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王艳xinwei

银虫 (小有名气)

[求助] 转化后菌落pcr有目的条带,小摇长菌,再大摇不长了,求帮助~

各位虫友,我最近做了两批农杆菌转化,挑单菌落小摇后做菌液PCR,有目的条带,接着就开始大摇,大概20-30ml加2-3菌液,做了六瓶,一点都没长,没找到原因,接着我又挑了一次菌落,又小摇浑浊,做了菌液PCR,有目的条带,再继续大摇,还是一点都没长,很是让我悲伤,不知道问题出现在哪地方了。。。。。。我每次的培养基都是YEB,且加的抗生素都一致,不过我小摇后的菌是放在四度冰箱做完菌液PCR后大摇的,这有影响吗?找不到原因了,是感受态做的不好吗,还是其他的原因。。。。。。求帮助
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坚持就是胜利
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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小丹木木: 金币+3, 鼓励交流经验 2012-08-25 19:47:16
王艳xinwei: 金币+3 2012-09-13 12:49:09
20-30ml加2-3(ul? ml?)。
个人觉得,你的做法有点问题。挑取单菌落后(可以用1.5ml离心管),用例如10ul水溶解稀释,取1ul作为模板做菌落PCR,剩余的9ul加入培养基及抗生素在PCR过程时就开始37度摇菌,等你的PCR完成后跑胶检测时,你的菌液浓度也差不多了。根据PCR结果选择需要扩大培养的菌,把这1管(可能你加LB是1ml开始)全部加到20ml培养基里,这样就容易获得你需要的了,而且时间也不会摇的太久。
你的做法是挑取后放在4度冰箱,这样,菌几乎不长,如果你又加了LB培养基(具体不知道你加了多少),如果你加的是1ML, 那么如果你只是吸取其中的一部分扩大培养,很有可能就没吸到或者量太少,因为你最开始的菌是溶解在这1ML培养基里的,或者你的菌还在培养基底部如果你开始加了LB后没有混匀的话。
3楼2012-08-25 14:57:08
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lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这种问题我以前遇到过,大摇时菌液加的太少了,你可以加个几百ul试试
生物化学与分子生物学
5楼2012-08-27 10:22:31
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irenescbg

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-28 13:53:04
农杆菌转化,有的时候会有污染,我想问一下你的小体积菌液的浓度是否正常,味道是否正常。另外,做PCR的时候没有必要把菌液放4度啊,继续摇就好了。前面有个人说得很对,多加点菌液会好的。我一般都是1:100稀释,摇大体积都没问题的。
请赐予我正能量吧!加油!
6楼2012-08-27 16:09:47
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tanglian8655

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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王艳xinwei: 金币+3 2012-09-13 12:49:45
会不会是假阳性啊,我们一般要要两次在酶切才算检测成功了。有时候第一次能长菌,PCR结果也不错,但是再次摇菌就没有东西了,我们判断为假阳性
8楼2012-08-28 13:20:18
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peitaokong

银虫 (小有名气)

一般小摇后,用甘油和菌种以1:1的比例混匀,保存后置于-80度冰箱里。在-4度的冰箱几个小时还行,时间长了,会影响菌种的活性的。
9楼2012-08-29 08:01:27
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peitaokong

银虫 (小有名气)

应该问题出在保存菌种时的方法欠妥。你如果小摇后,立即大摇,如果仍旧摇不起来,则可能是其他的问题。如果立即大摇能摇起来,就是你的保存菌种的方法欠妥。
10楼2012-08-29 08:05:44
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gjs713

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

接种量太少。。这个问题我师弟遇到过,那会刚开始做实验,50ml培养基接10ul种子 ,恁是一点没长。~~
勤奋、执着、专注,则无坚不破。
12楼2012-08-29 17:13:41
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gjs713

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
王艳xinwei: 金币+3 2012-09-13 12:50:43
你按1%或者更大的接种量试试看。
勤奋、执着、专注,则无坚不破。
13楼2012-08-29 17:14:12
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强子kycg

新虫 (小有名气)

我做的事大肠杆菌  转化后可以检测出目的条带   可是大瑶的时候总是摇不起来   求高手支招
14楼2013-05-08 09:55:25
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普通回帖
2楼2012-08-25 14:11:43
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王艳xinwei

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chenguestc at 2012-08-25 14:57:08
20-30ml加2-3(ul? ml?)。
个人觉得,你的做法有点问题。挑取单菌落后(可以用1.5ml离心管),用例如10ul水溶解稀释,取1ul作为模板做菌落PCR,剩余的9ul加入培养基及抗生素在PCR过程时就开始37度摇菌,等你的PCR ...

谢谢,估计有可能是放4度影响了菌的生长
坚持就是胜利
4楼2012-08-26 20:55:53
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王艳xinwei

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by irenescbg at 2012-08-27 16:09:47
农杆菌转化,有的时候会有污染,我想问一下你的小体积菌液的浓度是否正常,味道是否正常。另外,做PCR的时候没有必要把菌液放4度啊,继续摇就好了。前面有个人说得很对,多加点菌液会好的。我一般都是1:100稀释,摇 ...

谢谢
应该没有污染,我都有做重复,而且每个小摇都长起来了,量应该不少了,最后我将我小摇的将近5ml都加入了30ml液体培养基了,还是没摇起来,难道是菌活力不够?
坚持就是胜利
7楼2012-08-28 11:21:27
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