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linxiaolin08

捐助贵宾 (初入文坛)

[求助] 关于目的基因与载体连接后转化感受态细胞提取质粒的问题。 已有4人参与

大家好,最近我在做转化后提取质粒,准备下一步进行双酶切验证后转化表达菌株BL21。但是现在遇到了问题:
    目的基因与载体双酶切后连接转化(大肠杆菌28a),涂板后长菌了,我也进行挑菌PCR验证,大概挑了40多个但是只有20多个是阳性的,之后再摇菌准备提取连接后的质粒。第一次摇菌没有摇起来(使用的是挑菌做PCR验证的菌液,可能菌的密度比较小),第二次加大了接菌量(大概有150微升菌液),可是提了两次都没有成功,都是没有我想要的那么大的质粒条带,最上面有一条带,我拿去问老师老师说这是基因组DNA,不是质粒,但是我现在不知道是哪里出了问题。难道是我的菌液污染了?可是摇菌后闻起来就是大肠杆菌的味道,只是摇菌后的菌量相比正常28a摇起来量少。我确定步骤也没问题,因为我们相同时间一起做的用的同样的步骤正常的28a质粒就可以提出来。还有就是我发现一个现象,我用的是碱法抽提,第一步需要离心,离心后的沉淀不是白色,有点儿发粉色的那种,这是为什么呢?除了颜色有问题,其他的后续步骤跟正常一样没有发现有什么差别,再就是最后一步了,沉淀超级少,少到我用5微升DD水溶后浓度还非常低。很苦恼啊,各位大神帮帮我~~~如果是染菌了我需要重新涂板然后挑菌进行PCR验证么?还是说需要重新进行双酶切后连接转化?
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happydove

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

“大概挑了40多个但是只有20多个是阳性的”请问楼主是用什么方法验证的
双酶切比较可靠,如果是PCR,是否用的是一头通用引物和一头特异引物?
5楼2014-10-21 11:21:19
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linxiaolin08

捐助贵宾 (初入文坛)

有人可以帮帮我嘛~~~
2楼2014-10-21 08:37:47
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593318518

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
linxiaolin08: 金币+2 2014-10-27 11:29:33
初步感觉楼主的菌并没有污染,而是楼主插入的基因可能在E.coli 里面表达了,而这种表达产物(蛋白)对细菌具有毒性
3楼2014-10-21 10:07:16
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海之草

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
linxiaolin08: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-10-27 11:29:27
不知楼主的插入片段有多大,连接体系是不是比例有问题?对于双酶切连接克隆,50%的阳性率感觉有点偏低。楼主有检查过抗生素吗?有没有过期,有没有因为反复冻融而失效?
4楼2014-10-21 11:09:50
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