24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1366  |  回复: 9

jkamm

金虫 (正式写手)

[求助] 测序结果,why? 已有6人参与

请教下前辈:
我送的克隆菌液去测序,明明是挑单菌落摇菌的,可有几个样品返回说是非单克隆,测序峰有套叠,不明白,为什么是这样,请指教下问题出哪了。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wshi85

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-10-03 20:18:18
你应该上传你的测序峰图!这个无外乎两种情况。第一你挑菌,占到了其他的菌,挑菌时只需要沾到菌落就行,范围不要挑的太大!另一个看测序那边怎么处理你的菌液的,是直接提,还是第二次接菌提质粒测序?
很久没在虫虫上漂游了,觉得回归虫虫!
2楼2014-10-03 12:55:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuchange918

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-10-03 20:18:26
污染的可能性比较大,也就是有杂菌进入
3楼2014-10-03 16:28:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

随风飘摇11

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-10-03 20:18:32
出现套峰,一个可能是测序公司的问题,第二就是你本身样品的问题,不是单克隆。把你的样品送别家公司测个序就好了

[ 发自小木虫客户端 ]
天道酬勤
4楼2014-10-03 19:15:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wshi85

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 随风飘摇11 at 2014-10-03 19:15:06
出现套峰,一个可能是测序公司的问题,第二就是你本身样品的问题,不是单克隆。把你的样品送别家公司测个序就好了

其实找这个问题前,直接看峰图就行!没必要马上送其他公司!
很久没在虫虫上漂游了,觉得回归虫虫!
5楼2014-10-03 23:04:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
污染或者测序的引物特异性差,或者就是你的质粒上有两组基因
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
6楼2014-10-04 01:44:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

随风飘摇11

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wshi85 at 2014-10-03 23:04:07
其实找这个问题前,直接看峰图就行!没必要马上送其他公司!...

是的嘛?请教下如何从峰图上直接看是测序的问题还是样品本身的问题

[ 发自小木虫客户端 ]
天道酬勤
7楼2014-10-04 06:54:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wshi85

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 随风飘摇11 at 2014-10-04 06:54:01
是的嘛?请教下如何从峰图上直接看是测序的问题还是样品本身的问题
...

这不是一两句话说的清的,你测序测得多了就知道了!
很久没在虫虫上漂游了,觉得回归虫虫!
8楼2014-10-04 18:08:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未婚

金虫 (正式写手)

分子小生

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jkamm(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-10-04 21:58:38
我也出现了这样的问题,你是不是用的单向测序啊?
我送去了3个样进行双向测序,返回来6个结果,3个是错误的,1个是你说的套峰,另外两个是正确的测序结果。究其原因是单向测序时引物不好,或者正反向在NCBI上就是弄反了的,我的就是这样,反而反向测序像其他测序结果的正向测序结果一样漂亮,我推断为NCBI上的序列是正反向弄错了(个人之见啊,请多指教)。再送一次吧,我是提了质粒后直接测序的,双向要实在些,推荐双向测通! 、

望多多交流!
You can't depend on luck, so you had better focus on the others!
9楼2014-10-04 21:38:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gayy1990602

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你在划线挑菌送测序噻,,,,,再看看,有可能测序公司没有弄好
10楼2014-10-05 10:08:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jkamm 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +3 电气300求调剂不 2026-04-08 3/150 2026-04-10 10:19 by LHGeng
[考研] 材料调剂 +5 hzhahg 2026-04-06 5/250 2026-04-10 10:10 by may_新宇
[考研] 一志愿华中农微生物,288分,三年实验经历 +10 代fish 2026-04-09 10/500 2026-04-10 09:49 by potato妹
[考研] 297求调剂 +8 Kwgyz 2026-04-09 8/400 2026-04-09 23:22 by may_新宇
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +3 LZH(等待调剂中 2026-04-09 3/150 2026-04-09 21:29 by wutongshun
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +5 白云123456789 2026-04-09 7/350 2026-04-09 21:03 by 白云123456789
[考研] 278求调剂 +27 范婷娜 2026-04-07 31/1550 2026-04-09 20:49 by zhouxiaoyu
[考研] 085600材料与化工专硕329 求调剂 +24 额cc 2026-04-06 25/1250 2026-04-09 16:01 by wp06
[考研] 274求调剂 +5 山阿蔓 2026-04-07 5/250 2026-04-09 15:28 by 18828373951
[考研] 求调剂 +13 柒luck 2026-04-07 13/650 2026-04-08 22:46 by 猪会飞
[考研] 一志愿吉大化学327求调剂 +12 王王白石 2026-04-06 13/650 2026-04-08 16:05 by luoyongfeng
[考研] 304求调剂 +10 素年祭语 2026-04-06 17/850 2026-04-08 09:05 by 蓝云思雨
[考研] 313求调剂 +3 十六拾陆 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:20 by lbsjt
[考研] 259求调剂 +5 就爱吃土豆呀呀 2026-04-07 5/250 2026-04-07 22:40 by JourneyLucky
[考研] 081700化学工程与技术 一志愿中海洋 323 求调剂学校 +19 披星河 2026-04-03 19/950 2026-04-07 15:14 by 尽舜尧1
[考研] 信工所11408 340分 本科西安交大自动化 +3 moontrek 2026-04-06 3/150 2026-04-07 09:56 by chongya
[考研] 生物学学硕求调剂:351分一志愿南京师范大学生物学专业 +6 …~、王…~ 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:54 by macy2011
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 20:07 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿沪985,326分求调剂 +3 刘墨墨 2026-04-03 3/150 2026-04-04 11:16 by 悲伤的芋头
[考研] 材料专业383求调剂 +8 郭阳阳阳成 2026-04-03 8/400 2026-04-04 10:29 by Rednal.
信息提示
请填处理意见