24小时热门版块排行榜    

查看: 1656  |  回复: 11

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 3`RACE不出带的原因 已有2人参与

各位虫友:我现在想用3‘RACE拿一个基因的3’末端,我用的引物是我做荧光定量的引物和带接头的oligo-dt来做拼成一对扩的,现在是退火温度高的话不出带,而退火温度低的话就弥散,看不清具体的带。用toughdown程序也不理想,有同样的问题,我也用过67,64,61,58,55,52的温度梯度,也有同样的温度。我觉得我用的是特异引物,应该比较好扩,但就是没有明显的带,这是为什么啊?求大神解答啊。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

fuchange918

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-09-26 12:22:16
lwk5716: 金币+4, ★★★很有帮助, 谢谢! 2014-09-26 15:34:18
荧光定量引物是不可以的、应该重新设计上游引物。不知道你用的是哪个试剂盒,试剂盒说明书都带有相应的设计引物的TM值(一般要求较高,可以减少特异扩增)要求,因为接头引物的TM值就高,荧光定量的引物TM值应该偏低,一对引物的TM值相差太大的话就跑不出条带了
2楼2014-09-26 08:01:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuchange918

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lwk5716 at 2014-09-26 15:46:12
我没用试剂盒,用的全式金的反转录酶加上一个做genefish的带接头的oligodt扩的。...

那你可以用软件算一下接头引物的TM值啊
4楼2014-09-26 16:22:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuchange918

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
lwk5716: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-10-02 11:29:37
引用回帖:
8楼: Originally posted by lwk5716 at 2014-09-30 22:38:54
我的接头Tm值65度左右,上游引物接近58度。...

差距有点大(但不是绝对的),建议重新设计引物,最好是设计巢氏引物,第一轮用高保真酶跑,第二轮可以用LA或Ex Taq跑
9楼2014-10-01 17:30:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fuchange918 at 2014-09-26 08:01:56
荧光定量引物是不可以的、应该重新设计上游引物。不知道你用的是哪个试剂盒,试剂盒说明书都带有相应的设计引物的TM值(一般要求较高,可以减少特异扩增)要求,因为接头引物的TM值就高,荧光定量的引物TM值应该偏低 ...

我没用试剂盒,用的全式金的反转录酶加上一个做genefish的带接头的oligodt扩的。
3楼2014-09-26 15:46:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fuchange918 at 2014-09-26 16:22:33
那你可以用软件算一下接头引物的TM值啊...

嗯,好的。
5楼2014-09-27 08:35:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

laojiu9878

至尊木虫 (文坛精英)

九牛

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lwk5716: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-09-28 18:16:39
注意引物的正确与否,
但愿人长久
6楼2014-09-28 14:50:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by laojiu9878 at 2014-09-28 14:50:50
注意引物的正确与否,

应该是对的,谢谢。
7楼2014-09-28 18:16:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fuchange918 at 2014-09-26 16:22:33
那你可以用软件算一下接头引物的TM值啊...

我的接头Tm值65度左右,上游引物接近58度。
8楼2014-09-30 22:38:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by fuchange918 at 2014-10-01 17:30:52
差距有点大(但不是绝对的),建议重新设计引物,最好是设计巢氏引物,第一轮用高保真酶跑,第二轮可以用LA或Ex Taq跑...

谢谢你的回答!
10楼2014-10-02 11:37:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lwk5716 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +7 Lanmanbaby 2026-08-09 11/550 2026-08-09 17:48 by zhanghaozhu
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:27 by oEVWOejN9taj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:27 by oEVWOejN9taj
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:22 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:19 by oEVWOejN9taj
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:02 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:39 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:22 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 10:19 by 3OOjAIS77qg2
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
信息提示
请填处理意见