24小时热门版块排行榜    

查看: 1696  |  回复: 11

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 3`RACE不出带的原因 已有2人参与

各位虫友:我现在想用3‘RACE拿一个基因的3’末端,我用的引物是我做荧光定量的引物和带接头的oligo-dt来做拼成一对扩的,现在是退火温度高的话不出带,而退火温度低的话就弥散,看不清具体的带。用toughdown程序也不理想,有同样的问题,我也用过67,64,61,58,55,52的温度梯度,也有同样的温度。我觉得我用的是特异引物,应该比较好扩,但就是没有明显的带,这是为什么啊?求大神解答啊。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

fuchange918

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-09-26 12:22:16
lwk5716: 金币+4, ★★★很有帮助, 谢谢! 2014-09-26 15:34:18
荧光定量引物是不可以的、应该重新设计上游引物。不知道你用的是哪个试剂盒,试剂盒说明书都带有相应的设计引物的TM值(一般要求较高,可以减少特异扩增)要求,因为接头引物的TM值就高,荧光定量的引物TM值应该偏低,一对引物的TM值相差太大的话就跑不出条带了
2楼2014-09-26 08:01:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuchange918

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lwk5716 at 2014-09-26 15:46:12
我没用试剂盒,用的全式金的反转录酶加上一个做genefish的带接头的oligodt扩的。...

那你可以用软件算一下接头引物的TM值啊
4楼2014-09-26 16:22:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuchange918

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
lwk5716: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-10-02 11:29:37
引用回帖:
8楼: Originally posted by lwk5716 at 2014-09-30 22:38:54
我的接头Tm值65度左右,上游引物接近58度。...

差距有点大(但不是绝对的),建议重新设计引物,最好是设计巢氏引物,第一轮用高保真酶跑,第二轮可以用LA或Ex Taq跑
9楼2014-10-01 17:30:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fuchange918 at 2014-09-26 08:01:56
荧光定量引物是不可以的、应该重新设计上游引物。不知道你用的是哪个试剂盒,试剂盒说明书都带有相应的设计引物的TM值(一般要求较高,可以减少特异扩增)要求,因为接头引物的TM值就高,荧光定量的引物TM值应该偏低 ...

我没用试剂盒,用的全式金的反转录酶加上一个做genefish的带接头的oligodt扩的。
3楼2014-09-26 15:46:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fuchange918 at 2014-09-26 16:22:33
那你可以用软件算一下接头引物的TM值啊...

嗯,好的。
5楼2014-09-27 08:35:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

laojiu9878

至尊木虫 (文坛精英)

九牛

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lwk5716: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-09-28 18:16:39
注意引物的正确与否,
但愿人长久
6楼2014-09-28 14:50:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by laojiu9878 at 2014-09-28 14:50:50
注意引物的正确与否,

应该是对的,谢谢。
7楼2014-09-28 18:16:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fuchange918 at 2014-09-26 16:22:33
那你可以用软件算一下接头引物的TM值啊...

我的接头Tm值65度左右,上游引物接近58度。
8楼2014-09-30 22:38:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwk5716

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by fuchange918 at 2014-10-01 17:30:52
差距有点大(但不是绝对的),建议重新设计引物,最好是设计巢氏引物,第一轮用高保真酶跑,第二轮可以用LA或Ex Taq跑...

谢谢你的回答!
10楼2014-10-02 11:37:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lwk5716 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +3 Ldrop2023 2026-08-13 3/150 2026-08-14 14:07 by gltch
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +4 majunge000 2026-08-11 6/300 2026-08-13 16:50 by 四季常青藤
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
信息提示
请填处理意见