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caoxinxinxin

新虫 (初入文坛)

[求助] 新设计的引物扩出来有两条带,是什么原因啊?大哥大姐!

亲爱的师兄师姐,小妹最近在做一个植物基因的克隆,我是分成两段来扩的。实验已经扩出来前半段序列,后半段序列利用cDNA设计得引物在DNA里面扩增(主要目的是想把外显子和内含子都扩增出来),但是在扩后半段序列跑的时候,电泳成像显示有两条带,一条大约1600bp,一条大约1300bp,而我的目的条带在1600-2000bp之间才对。我用的体系是:
DNA  4μL
plus Buffer  5μL
dNTP   4μL
PrF      1μL
   R      1μL
plus  TaqE  0.8μL
ddH2O   34.2
程序是:
95℃   5min
95℃   30sec
退火(48-60℃)1min
72℃   1min20sec
72℃  7min
12℃   forever
其中一对引物:
Two primers complementarity.                               
Max complementarity in continuous: 3 bp, free energy= 0.30 Kcal/mol                               
     5'-TGAAGAAGATGCTGGGGAAGAAGA-3'                               
                                 |||                               
3'-GTTATTTGGGAGGCGAAATAGG-5'                               
请师兄师姐帮忙指点一下,感激不尽啊!!祝师兄师姐实验顺利,生活愉快!
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caoxinxinxin

新虫 (初入文坛)

看了一下您提供的这些帖子,但是对我的这个实验结果帮助不是很大,请问有没有具体的实验指点啊?谢谢。能帮我分析一下出现我这样实验结果的原因吗?谢谢
2楼2014-09-19 14:52:22
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