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普通PCR遇到的问题,求助大神们
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hajierlove
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普通PCR遇到的问题,求助大神们
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扩全长基因,基因大小825bp。八个温度梯度(52.5-54),上下游引物Tm值分别为47.1、51.6、选用这个温度是因为之前梯度PCR未出来条带,在53度有杂带。图片如下,我应该怎么继续优化条件,虫虫们指导一下。谢谢啦
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2014-07-02 13:16:18
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Originally posted by
zhangyunjing
at 2014-07-02 13:51:01
应该是引物设计的不好,引物的Tm值太低。关于53℃有杂带的问题,有几个方面减少非特异性扩增,一方面采用热启动酶,另外可以添加一些PCR添加剂,如甜菜碱,DMSO等;还可以采用降落PCR的方法减少非特异性扩增。最好将 ...
扩全长,避免发夹结构,这个引物差不多只能这样啦。要不就出现发夹结构了
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2014-07-02 13:55:22
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只能说引物不行 温度太低 小900的片段引物设计好不会很难的
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2014-07-04 08:12:09
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Tm值相差好几度 没问题么
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这非特异也太严重了,换个酶试试看。
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2014-07-02 17:21:19
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升高温度试试吧,能降低非特异性带
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2014-07-02 18:19:59
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Originally posted by
zhangyunjing
at 2014-07-02 13:51:01
应该是引物设计的不好,引物的Tm值太低。关于53℃有杂带的问题,有几个方面减少非特异性扩增,一方面采用热启动酶,另外可以添加一些PCR添加剂,如甜菜碱,DMSO等;还可以采用降落PCR的方法减少非特异性扩增。最好将 ...
好的,谢谢,我这几天就着手再试试
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2014-07-03 16:12:40
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扩全长,避免发夹结构,这个引物差不多只能这样啦。要不就出现发夹结构了...
引物里面即使有发夹结构也能扩出来,只要3‘端没有就可以
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8楼
2014-07-03 16:25:54
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2014-07-04 22:57:40
你最下面的引物二聚体也太亮了,引物少加点,看引物问题不是很大,关键是用什么做的模板,质粒的话很容易就扩出来了,基因组或者cDNA的话关键是要保证模板质量,10倍稀释后退火温度用55°扩扩看
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2014-07-04 14:56:15
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