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xzd5517520

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】关于降落pcr的问题! 已有4人参与

请教各位大侠:什么时候要做降落pcr??还有就是在pcr仪上是怎么设计的??求教!
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小小豆豆

金虫 (小有名气)

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amisking(金币+5):good! 2010-09-12 22:22:38
降落PCR,主要用于PCR的条件的优化。在许多情况下引物的设计使得PCR难以进行,例如特异性不够易错配等。退火温度过高会使PCR效率过低,但退火温度过低则会使非特异扩增过多。这虽然可以通过反复尝试来优化,但费时费力。降落PCR提供了一个较为简易的优化方法。其原理大致是这样的。首先在较高的温度下扩增,此时虽然扩增效率低,但非特异扩增基本没有。随着退火温度的降低,非特异扩增会逐步增多。但由于此时特异的扩增产物已经达到一定的数量优势,因此会对非特异扩增产生强烈的竞争抑制,从而大幅提高PCR的特异性和效率。这一PCR技术已经大量地进入医疗临床应用。现在,以高通量PCR为基础的检测方法、如人的 HLA分型 大多采用这一技术。
一般的PCR仪上,都可以通过每一次循环降低一定退火温度的方式来实现,具体的看一下仪器说明书就明白了,呵呵,不难的。
2楼2010-09-12 20:45:01
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
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amisking(金币+2):鼓励交流! 2010-09-12 22:22:59
原理,楼上说的很清楚了,至于PCR设置,一般来说PCR会有每个循环降低一定温度的功能,即使没有,自己手动就可以,因为降落PCR只在前面几个循环降落才有意义,所以手动设置也不是很麻烦。广义的降落PCR,也可能是几个循环降落一次,这种情况还必须手动设置
3楼2010-09-12 22:16:12
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hongyuan1016

铁虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
Touchdown PCR不是指温度降低,而是升高。具体来说是前几个循环用一个低的退火温度,然后提高温度再几个循环,然后再提高温度再几个循环,最后停在一个较高的温度扩增就行,这样的话温度低时扩出的产物包括特异的和非特异的,温度逐渐升高,将非特异逐渐选择掉。以个人体会给你举个例子:让一个分子生物学的新手去建一个cDNA文库,建成的可能性很小,如果让这个人先按照建库的程序拿别的东西锻炼锻炼,她建成文库的可能性就会增大。
4楼2010-09-14 16:43:39
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hongyuan1016 at 2010-09-14 16:43:39:
Touchdown PCR不是指温度降低,而是升高。具体来说是前几个循环用一个低的退火温度,然后提高温度再几个循环,然后再提高温度再几个循环,最后停在一个较高的温度扩增就行,这样的话温度低时扩出的产物包括特异的 ...

相比之下还是认为二楼的对。非特异的东西会越来越多,而不会被选择掉,PCR的优势(可怕之处)就在于会几何级的增加。
请参考:http://baike.baidu.com/view/2200786.html?tp=4_01
金币是赌出来的
5楼2010-09-14 17:01:52
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