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反转录RNA时出现基因组DNA的原因有哪些?
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反转录RNA时出现基因组DNA的原因有哪些?
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问题如题目的,老师只说提取不彻底的,可是那些方面会造成提取不彻底呢?老师当时解释的也不是很理解的,希望有智者可以帮忙解答一下的,谢了
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提取RNA时应该加入Dnase I在37度消化DNA
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2014-05-16 08:52:21
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忘说了,是cDNA在琼脂凝胶电泳时出现了基因组DNA
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2楼
2014-05-15 23:57:14
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难得糊涂gtt
at 2014-05-16 08:52:21
提取RNA时应该加入Dnase I在37度消化DNA
我们根据老师给的实验步骤做的,好像没有加Dnase,进行电泳时出现了基因组DNA,问老师原因也没说出所以然来,只说提取不完全,可是在操作步骤上有哪些方面会造成呢?
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4楼
2014-05-17 23:19:06
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个人感觉最重要的步骤是加氯仿后一定要混匀, 后面吸取上清的时候一定不要贪多而吸到其他液层,希望楼主实验早日顺利
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夫天地者万物之逆旅
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2014-05-19 07:57:25
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本来抽提RNA的试剂就能抽提出DNA来。现在市场上买的任何一个RNA抽提试剂盒都是这样的,只是有的试剂盒在里面就直接加入了DNA消化酶,所以抽提出来就没有DNA,一般的试剂盒都要进行DNA消化才鞥得到纯的RNA。最主要的产生DNA的地方,就是氯仿萃取哪一步!
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2014-05-19 08:42:25
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我们根据老师给的实验步骤做的,好像没有加Dnase,进行电泳时出现了基因组DNA,问老师原因也没说出所以然来,只说提取不完全,可是在操作步骤上有哪些方面会造成呢?
...
不经过Dnase I消化的话肯定就会有gDNA残留。得先确保你们用的试剂里是否包含这个成分。操作步骤上,进行DNase I 消化后,是直接进行反转录或是再重新纯化就要仔细阅读说明书。并且,要确保试剂没有被污染。推荐All-in-One™ First-Strand cDNA Synthesis Kit.
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一切有为法,如露如闪电
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2014-05-19 11:18:08
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ls有人说的对,市场上任何一种提取试剂盒其实都没办法说完全去除dna。第一:或者本就含有dna酶,那样肯定可以去吃dna,第二:有的提取液是提取离心后是分层的,每一层的东西都不一样,所以ls说的不贪多是对的——贪多嚼不烂。
和沉淀其实也有关系。我记得有的试剂比如licl就可以专门沉淀rna不沉淀dna,这也是一个去除rna中dna的方法。我基本是在rna中加dna酶。
总之,要在试验操作中多摸索,对原理要多了解。
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8楼
2014-05-19 11:47:26
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at 2014-05-19 07:57:25
个人感觉最重要的步骤是加氯仿后一定要混匀, 后面吸取上清的时候一定不要贪多而吸到其他液层,希望楼主实验早日顺利
谢谢哈!我的感觉也是如此的。。。谢了
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2014-05-22 12:19:15
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ls有人说的对,市场上任何一种提取试剂盒其实都没办法说完全去除dna。第一:或者本就含有dna酶,那样肯定可以去吃dna,第二:有的提取液是提取离心后是分层的,每一层的东西都不一样,所以ls说的不贪多是对的——贪 ...
嗯嗯,谢了哈
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