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rjghx

新虫 (初入文坛)

[求助] 在DNA提取过程中遇到了困惑,希望朋友们可以解答一下,提DNA 的高手请进!!!

在DNA提取过程中遇到了困惑,希望朋友们可以解答一下!!!
提取对象为:植物核果的去核干燥果实
方法:CTAB法及SDS法。
药材数量:4g,大量粗提取。
在提取的过程中到没有什么异常出现,但最后一步用乙醇或异丙醇沉淀时,出现了大量胶状沉淀,按常规会判断为多糖,但在电泳后发现板孔附近并没有多糖的亮点,同时DNA的条带也是一点都没有,这个实验我试了很多方法,CTAB法,SDS法,大量提取,微量提取。也参考文献试了很多改良的方法,都没有得到DNA的条带。请问各位有什么高见?
附上照片,用5ml及1.5ml离心管做。
此图分别为用醇沉淀瞬间出现的大量胶状沉淀。
离心沉淀。
用75醇洗涤后转入1.5 离心管。
电泳示意图。
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healerly

禁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3, EPI+1): 鼓励应助 2011-07-20 20:32:46
你胶孔中很干净,说明抽提的很干净~~
这一方面我也不是很懂,我只是研一而已~~
我有几个想法,你可以考虑一下,我不是这方面的专家,只能算热心了~~呵呵~~不知道能不能帮上忙啊~~
1,显然你提DNA的样品差别太大了,叶子和果实与干果差别有点大把,干果中水分含的很少,如果再按照原先的方法在处理上是不是应该改进一下?
2,CTAB在65℃水浴4个小时,有点长把~~~基因组会不会降解呢?我这边是水浴时间不能太长,太长了基因组会降解。
3,继续查查有没有做这方面的文献吧~~~
加油~~
heal the world!!!
5楼2011-07-20 20:30:24
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xuzhu598

铁虫 (小有名气)

我是来学习大家的技术的
9楼2011-07-30 22:30:13
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普通回帖

healerly

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
西瓜(金币+4): 鼓励交流 2011-07-20 16:27:57
本帖内容被屏蔽

2楼2011-07-20 11:18:35
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rjghx

新虫 (初入文坛)

我用的也有CTAB法,我先用液氮研磨成细粉,大概5-6次,再用提取缓冲液(0.25mol Nacl  ,0.25mol Tris, 50mmol EDTA, 调PH=8.0)冰浴一小时,而后用 2×CTAB提取缓冲液65℃水浴4小时。氯仿异戊醇除杂5次(事实上五次后还有杂质,我试过一直除杂,就一直都有)。无水乙醇加醋酸钾沉淀。
我们用同样的方法对叶子及鲜果提取都有结果,唯独对干燥果实一点用也没有,并且不知道大量出现的胶状沉淀是什么?
附上跑板图,你参谋一下.......
3楼2011-07-20 16:02:04
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rjghx

新虫 (初入文坛)

我做的也是微量的,只是不出结果,用0.2g的提,跑完后还是空板一张,因为怀疑含量太少,所以就试着用大量的去提取,只求能提出来!
4楼2011-07-20 16:06:25
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zhoujunbo

新虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励! 2011-07-21 11:37:11
我可以告诉你,你是把多糖和果胶提取出来了!!另外,65读水浴4小时?通常30分钟足矣,为什么用4小时,DNA早降解了。
6楼2011-07-20 22:13:01
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rjghx

新虫 (初入文坛)

恩,既然抽提的挺干净,那出现的大量沉淀又是什么呢?看文献时好像看到海藻的提取方法中有一个LICL沉淀法,不知你们试过没?
7楼2011-07-21 09:14:49
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mlw0927

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2011-07-23 17:14:54
水浴时间太长,通常0.5-1h最好,不然出来的全是杂质,另外,你的提取液怎么有点粉红色,是不是被氧化的原因
养在窗台上,梦想着海洋~
8楼2011-07-23 16:17:04
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我和我自己

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

CTAB水浴时间太长了吧,我们就是水浴40min,每十分钟上下颠倒一次,以充分接触
10楼2011-08-01 16:10:31
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