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lyzjc

银虫 (小有名气)

[求助] 求助,PCR总是P不出条带!!求大神 已有1人参与

背景-------我是做的野生动物微卫星遗传多样性研究,提取的DNA是从粪便用试剂盒提取的,琼脂糖电泳条带都在2000kb以上,且大部分比较亮。引物是从外文文献上拿来直接用的。Taq酶,buffer这些也都是新买的,试剂上面应该没什么问题。
      PCR体系用12.5微升体系:
                              buffer:1.25   
                              dNTP:1.25
                              taq酶:0.1
                                F:1
                                R:1
                               DNA:1.5
                               dd水:6.4
问题来了,用引物1在这个体系下,用八个DNA来分别作温度梯度PCR,只有一个DNA能P出来条带,且在三个温度下都有条带,然后用另一个在这个体系下没出条带的DNA,只是把DNA模板量调到0.5微升,其他不变,结果就能P出来,这就是不是说明DNA模板量浓度不同,每个DNA都要对应一个需加入的模板量么??也就是说每个DNA都要对应一个体系么????
那么,我的DNA有将近二百个样,每个DNA都要摸索一下要加的模板量的话,还能毕业么?怎么办啊??老师让我测一下DNA浓度,大概0.15微克每微升,用同一个DNA测两次的时候,两次读数相差不小,是仪器的问题还是没混匀啊?应该怎么混匀呢,我都是吹打五十次左右的。怎么办?求大神指点啊。。。。
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fly_锋

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-06-26 18:21:31
不好意思,我估计帮不上太多忙!只是有点自己的意见,首先,我看你的体系里面忘了写Mg2+了吗?另外,DNA浓度太大是会影响PCR效果的,我是做贝类的,也是利用微卫星分析,我们实验室一般DNA浓度在20-50ng/ul ,是纳克!!!一般是10ul体系放1ul!我有感觉你的DNA浓度过大了!在提取DNA后,电泳检测后就可以基本确定浓度,没有必要说一定得精确检测!
2楼2014-06-26 14:12:02
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