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ming0515

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] PCR条件,请指导。 已有4人参与

大家好,
最近进行PCR扩增,产物大小理论值为1580bp,用到的PCR条件为下列两种:
①94℃   5min;94℃   30s,55℃   30s,72℃   1.5min;72℃ 10min;
②94℃   5min;94℃   30s,55℃   1.5min,72℃   30s;72℃ 10min;

让人纠结的是用①正常的PCR条件尝试各种方法就是P不出条带(也做过梯度PCR45-57℃),
但是因为一个意外PCR条件采用了②条件,扩增出了正确的产物。
对此想请教为什么错误的条件②可以P出正确产物,且以后的验证实验是不是也需要采取②条件。
谢谢!
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百代繁华一朝都,谁非过客;千秋明月吹角寒,花是主人;江山图一快,人,不见血,刀,不收锋。
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 2 2014-04-06 23:47:58
ming0515: 金币+2, ★★★★★最佳答案 2014-04-07 16:56:13
55°C的时候,Taq酶还是有活性的,就是说55度的时候,除了引物配对之外,还有延伸的作用,只是速度比较慢而已,72度只有延伸,引物和模板是无法配对的。
行至水穷处,坐看云起时
6楼2014-04-06 16:46:55
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖


ming0515: 金币+1, ★★★★★最佳答案 2014-04-07 16:56:26
如果你把55度的时间延长足够,这样72度这一步就可以省略了。
行至水穷处,坐看云起时
8楼2014-04-06 22:02:09
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