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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 丝状真菌ITS引物及PCR条件？
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aloon111

金虫 (正式写手)

[求助] 丝状真菌ITS引物及PCR条件？

通用的丝状真菌ITS引物及PCR条件？
黑曲霉和青霉能同用一对引物吗？
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汇天下之贤
1楼 2012-06-11 20:31:04
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asznpb

木虫 (正式写手)
我是来学习的，嗯嗯
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显微镜下的世界很精彩！
2楼2012-06-11 20:44:59
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bigdale

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
aloon111: 金币+1, ★★★很有帮助, 0.0 2012-06-14 17:07:37
我们实验室用的是ITS4和ITS5，还有ITS1和ITS2.是真菌基本都可以用同一引物。除了极特殊的。
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3楼2012-06-11 22:18:42
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angelyou

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
aloon111: 金币+1, ★★★很有帮助, 0.0 2012-06-14 17:07:08
我们实验室一般真菌鉴定都是ITS1和4，通用引物，基本都可以扩出来
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4楼2012-06-12 08:51:03
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aloon111

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by angelyou at 2012-06-12 08:51:03
我们实验室一般真菌鉴定都是ITS1和4，通用引物，基本都可以扩出来

PCR条件....？
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汇天下之贤
5楼2012-06-12 09:06:21
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Lipingqin

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我们实验室一直都是用的ITS1-F 和 ITS4
退火温度55  cycles 35
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滚蛋吧，这操蛋的人生
6楼2012-06-12 10:23:31
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aloon111

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Lipingqin at 2012-06-12 10:23:31
我们实验室一直都是用的ITS1-F 和 ITS4
退火温度55  cycles 35

ITS1引物序列TCCGTAGGTGAACCTGCGG
还是TCCGTAGGTGAACCTGCGC？最后一个碱基不一样，有影响吗？
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汇天下之贤
7楼2012-06-12 11:07:17
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Lipingqin

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by aloon111 at 2012-06-12 11:07:17
ITS1引物序列TCCGTAGGTGAACCTGCGG
还是TCCGTAGGTGAACCTGCGC？最后一个碱基不一样，有影响吗？...

ITS1-F  CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA（5‘-3‘）
ITS4   TCCTCCGCTTATTGATATGC（5‘-3‘）
我们实验室是用的以上引物，扩增ITS区用于真菌鉴定，主要是一类细胞有隔的菌丝深色的真菌，一直用的这对，具体的我也不大清楚呢
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滚蛋吧，这操蛋的人生
8楼2012-06-12 11:28:48
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angelyou

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by aloon111 at 2012-06-12 09:06:21
PCR条件....？...

94 5min
94  1min 54  1min 72 1min  36cycle
72  10min
4 5min
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9楼2012-06-13 12:05:08
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快乐小托儿

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Lipingqin at 2012-06-12 10:23:31
我们实验室一直都是用的ITS1-F 和 ITS4
退火温度55  cycles 35

你能实验室是做哪些真菌哇  用这些引物  是不是一般的真菌都能做出来呢？  谢谢哈
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10楼2013-05-02 20:23:23
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