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821078607

银虫 (小有名气)

[求助] 有关PCR引物

我想通过PCR测基因的相对表达量，想从以下内标中选一个，各位PCR高手给点意见哈
β-actin
      F:CGGGAA ATCGTGCGTGACAT
      R:GAACTTTGGGGGATGCTCGC       放大：712bp
这一段扩增的会不会有点长，会导致效率低啊？
β-actin
       F:GTGGGGCGCCCCAGGCACCA
       R:CTCCTTAATGTCACGCACGATTTC
这一段我不知道扩增了多少bp
GAPDH  
      F:GAAGGTGAAGGTCGGAGTC
      R:GAAGATGGTGATGGGATTTC      放大：226bp
这一对的后引物头三个和后三个配对，有没有影响啊？
以上三对内参基因相比而言，那一对更好？
大家给新手点建议，谢谢各位了！
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1楼 2012-05-10 21:46:47
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gywyl1977

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
821078607: 金币+2 2012-05-10 22:38:47
1不行，太长，一般都在200bp左右，否则扩增效率会降低。
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2楼2012-05-10 22:15:11
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821078607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gywyl1977 at 2012-05-10 22:15:11:
1不行，太长，一般都在200bp左右，否则扩增效率会降低。

谢谢哈 我也觉得有点太长
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3楼2012-05-10 22:38:38
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孙启亮

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 专家考核 2012-05-11 13:39:57
821078607: 金币+5, 谢谢 2012-05-12 10:55:49
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tool ... ?LINK_LOC=BlastHome  去这个网址进行引物blast，这样就知道扩增片段长度了。
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4楼2012-05-10 22:44:28
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