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821078607

银虫 (小有名气)

[求助] 有关PCR引物

我想通过PCR测基因的相对表达量,想从以下内标中选一个,各位PCR高手给点意见哈
β-actin
      F:CGGGAA ATCGTGCGTGACAT
      R:GAACTTTGGGGGATGCTCGC       放大:712bp
这一段扩增的会不会有点长,会导致效率低啊?
β-actin
       F:GTGGGGCGCCCCAGGCACCA
       R:CTCCTTAATGTCACGCACGATTTC
这一段我不知道扩增了多少bp
GAPDH  
      F:GAAGGTGAAGGTCGGAGTC
      R:GAAGATGGTGATGGGATTTC      放大:226bp
这一对的后引物头三个和后三个配对,有没有影响啊?
以上三对内参基因相比而言,那一对更好?
大家给新手点建议,谢谢各位了!
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gywyl1977

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
821078607: 金币+2 2012-05-10 22:38:47
1不行,太长,一般都在200bp左右,否则扩增效率会降低。
2楼2012-05-10 22:15:11
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821078607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gywyl1977 at 2012-05-10 22:15:11:
1不行,太长,一般都在200bp左右,否则扩增效率会降低。

谢谢哈 我也觉得有点太长
3楼2012-05-10 22:38:38
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孙启亮

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 专家考核 2012-05-11 13:39:57
821078607: 金币+5, 谢谢 2012-05-12 10:55:49
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tool ... ?LINK_LOC=BlastHome  去这个网址进行引物blast,这样就知道扩增片段长度了。
4楼2012-05-10 22:44:28
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