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aloon111

金虫 (正式写手)

[求助] 丝状真菌ITS引物及PCR条件?

通用的丝状真菌ITS引物及PCR条件?
黑曲霉和青霉能同用一对引物吗?
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汇天下之贤
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asznpb

木虫 (正式写手)

我是来学习的,嗯嗯
显微镜下的世界很精彩!
2楼2012-06-11 20:44:59
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bigdale

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
aloon111: 金币+1, ★★★很有帮助, 0.0 2012-06-14 17:07:37
我们实验室用的是ITS4和ITS5,还有ITS1和ITS2.是真菌基本都可以用同一引物。除了极特殊的。
3楼2012-06-11 22:18:42
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angelyou

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
aloon111: 金币+1, ★★★很有帮助, 0.0 2012-06-14 17:07:08
我们实验室一般真菌鉴定都是ITS1和4,通用引物,基本都可以扩出来
4楼2012-06-12 08:51:03
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aloon111

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by angelyou at 2012-06-12 08:51:03
我们实验室一般真菌鉴定都是ITS1和4,通用引物,基本都可以扩出来

PCR条件....?
汇天下之贤
5楼2012-06-12 09:06:21
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Lipingqin

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我们实验室一直都是用的ITS1-F 和 ITS4
退火温度55  cycles 35
滚蛋吧,这操蛋的人生
6楼2012-06-12 10:23:31
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aloon111

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by Lipingqin at 2012-06-12 10:23:31
我们实验室一直都是用的ITS1-F 和 ITS4
退火温度55  cycles 35

ITS1引物序列TCCGTAGGTGAACCTGCGG
还是TCCGTAGGTGAACCTGCGC?最后一个碱基不一样,有影响吗?
汇天下之贤
7楼2012-06-12 11:07:17
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Lipingqin

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by aloon111 at 2012-06-12 11:07:17
ITS1引物序列TCCGTAGGTGAACCTGCGG
还是TCCGTAGGTGAACCTGCGC?最后一个碱基不一样,有影响吗?...

ITS1-F  CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA(5‘-3‘)
ITS4   TCCTCCGCTTATTGATATGC(5‘-3‘)
我们实验室是用的以上引物,扩增ITS区用于真菌鉴定,主要是一类细胞有隔的菌丝深色的真菌,一直用的这对,具体的我也不大清楚呢
滚蛋吧,这操蛋的人生
8楼2012-06-12 11:28:48
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angelyou

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by aloon111 at 2012-06-12 09:06:21
PCR条件....?...

94 5min
94  1min 54  1min 72 1min  36cycle
72  10min
4 5min
9楼2012-06-13 12:05:08
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快乐小托儿

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by Lipingqin at 2012-06-12 10:23:31
我们实验室一直都是用的ITS1-F 和 ITS4
退火温度55  cycles 35

你能实验室是做哪些真菌哇  用这些引物  是不是一般的真菌都能做出来呢?  谢谢哈
10楼2013-05-02 20:23:23
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