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007TNT

木虫 (小有名气)

scientific businessor

[交流] PCR条件摸索(产物长度在1100BP) 已有9人参与

各位大侠:


              请问我的产物长度在1100BP以上,该用多久的延伸时间呢?循环应该怎样才能跑出条带呢?


                 谢谢了。。
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wushuwei1104

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-24 13:46:47
一般1100bp大小的产物产物退火1分钟就差不多了,如果2000bp的话可能就要90秒了,我们这PCR产物1100bp左右的话就退火1分钟。(94℃ 2分钟,94℃30秒 退火温度30秒 72度1分钟,72℃10分钟)。
退火温度的话可能需要条件摸索,不妨做个温度梯度,但经验上退火温度是你引物合成单上标明的退火温度稍微低2℃。
循环数的话一般35个循环,跑胶观察,条带太亮可适当降低循环数,条带暗的话可适当增加循环数。
呵呵,试试吧!!祝君好运!
勤能补拙
3楼2012-04-24 10:04:32
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普通回帖

sl35537417

木虫 (正式写手)

延伸一般1min左右吧,
至于退火温度等等具体这个要自己摸索
2楼2012-04-24 04:51:18
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damaomao

禁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

4楼2012-04-24 10:54:11
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xujian568

至尊木虫 (著名写手)

Count XU


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kod的话,1000bp/20s,请参考你自己的酶说明书。
活着就要让人感受到你的存在。
5楼2012-04-24 11:47:29
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moucheng

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
一般pcr用的Taq酶都有说明延伸速度。
人活在世界上不容易,凡事多看开些,开开心心,快快乐乐,健康长寿
6楼2012-04-24 14:17:51
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007TNT

木虫 (小有名气)

scientific businessor

引用回帖:
3楼: Originally posted by wushuwei1104 at 2012-04-24 07:04:32:
一般1100bp大小的产物产物退火1分钟就差不多了,如果2000bp的话可能就要90秒了,我们这PCR产物1100bp左右的话就退火1分钟。(94℃ 2分钟,94℃30秒 退火温度30秒 72度1分钟,72℃10分钟)。
退火温度的话可能需要 ...

很详细,谢谢啊
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7楼2012-04-25 22:41:30
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007TNT

木虫 (小有名气)

scientific businessor

引用回帖:
4楼: Originally posted by damaomao at 2012-04-24 07:54:11:
延伸时间用90秒,对应的退火温度可以设几个梯度

嗯,谢谢你的建议
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8楼2012-04-25 22:42:45
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xudabin98

木虫 (正式写手)

★ ★
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小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-27 13:33:43
这个你要参照你用的酶,每秒钟能够延伸多少个碱基,然后就可以算出你的退火温度了,要是不放心,可以80S,普通PCR是个很“贱”的实验,随便做做就可以做出来了。
9楼2012-04-26 13:22:51
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sincerewei

铁杆木虫 (著名写手)

内容已删除
10楼2012-04-26 13:54:19
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