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007TNT

木虫 (小有名气)

scientific businessor

[交流] PCR条件摸索(产物长度在1100BP) 已有9人参与

各位大侠:


              请问我的产物长度在1100BP以上,该用多久的延伸时间呢?循环应该怎样才能跑出条带呢?


                 谢谢了。。
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xujian568

至尊木虫 (著名写手)

Count XU


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kod的话,1000bp/20s,请参考你自己的酶说明书。
活着就要让人感受到你的存在。
5楼2012-04-24 11:47:29
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查看全部 13 个回答

sl35537417

木虫 (正式写手)

延伸一般1min左右吧,
至于退火温度等等具体这个要自己摸索
2楼2012-04-24 04:51:18
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wushuwei1104

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-24 13:46:47
一般1100bp大小的产物产物退火1分钟就差不多了,如果2000bp的话可能就要90秒了,我们这PCR产物1100bp左右的话就退火1分钟。(94℃ 2分钟,94℃30秒 退火温度30秒 72度1分钟,72℃10分钟)。
退火温度的话可能需要条件摸索,不妨做个温度梯度,但经验上退火温度是你引物合成单上标明的退火温度稍微低2℃。
循环数的话一般35个循环,跑胶观察,条带太亮可适当降低循环数,条带暗的话可适当增加循环数。
呵呵,试试吧!!祝君好运!
勤能补拙
3楼2012-04-24 10:04:32
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damaomao

禁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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4楼2012-04-24 10:54:11
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