| 查看: 1447 | 回复: 3 | ||
[求助]
BSP 引物问题 已有1人参与
|
|
最近在做MeDIP-Seq的验证实验，挑了些DMR做BSP(即亚硫酸氢盐测序PCR)。已经用MethPrimer设计好了引物。可是目前个人觉得有点问题，就是我们是用MethPrimer设计的引物来扩亚硫酸氢盐转换过的DMR。但是如果没有扩出来条带，是因为亚硫酸氢盐转换没成功 or 成功了 但DNA损失太多才扩不出来呢，还是因为引物没有设计好呢？是不是需要加类似阳性对照模板？可是用什么呢，没有转换过的原始DNA怕是扩不出来的吧，引物是针对转换过的序列设计的呢。 PS: 我的DMR都是500bp的（虽然有差异的可能只是其中一部分，但是MeDIP-Seq生物信息分析时设置的window大小即为500bp），那么MethPrimer设计引物时，需要引物的产物必须完全包括这500bp吗？还是能够包括差异甲基化区域即可？主要怕到时候文章里不好解释。 先谢过各位啦！ |
回复此楼» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有285人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有7人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于一对引物同时扩增多个不同基因的问题
已经有10人回复
- 如何避免单引物扩增，扩出的目的片段为什么都是单引物扩增
已经有4人回复
- 妹子急求： 甲基化特异性PCR引物设计
已经有7人回复
- 只知道重亚硫酸盐处理后的DNA序列的引物，怎么找到原目的序列呢？
已经有3人回复
- RT-PCR引物稀释问题，欢迎战友们进来指导！急盼中
已经有16人回复
- 引物设计区域选择问题
已经有7人回复
- RACE的引物设计问题
已经有7人回复
- 点突变引物设计的问题
已经有11人回复
- ISSR-PCR的引物问题是只用1条？
已经有9人回复
- 求助-基因克隆及引物设计的问题
已经有6人回复
- 引物设计的问题
已经有13人回复
- 原核表达引物设计的问题
已经有6人回复
- primer 5 设计引物的问题
已经有16人回复
- 合成一段DNA的问题？引物，PCR
已经有13人回复
- 利用Primer 5设计引物问题
已经有6人回复
- 做蛋白体外表达时的引物设计问题！
已经有12人回复
- 【求助/交流】PCR引物二聚体问题
已经有11人回复
- 克隆基因全长引物设计问题
已经有32人回复
ADTechnology 
捐助贵宾 (著名写手)
表观遗传学专业供应商
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 12218.7
- 散金: 1762
- 红花: 1
- 帖子: 2626
- 在线: 49.8小时
- 虫号: 1787705
- 注册: 2012-04-30
- 专业: 人类遗传学
【答案】应助回帖
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
感谢参与，应助指数 +1
您做的是什么标本的MeDIP-Seq呢?市场上有相应的阳性对照的。人的甲基化的非甲基化的；大鼠甲基化的和非甲基化的；小鼠甲基化的和非甲基化的。具体请参考：http://www.aderr.com/cn/main.php ... 06&id=24165  |
2楼2014-02-20 14:54:21
3楼2014-02-22 12:08:15
ADTechnology
捐助贵宾 (著名写手)
表观遗传学专业供应商
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 12218.7
- 散金: 1762
- 红花: 1
- 帖子: 2626
- 在线: 49.8小时
- 虫号: 1787705
- 注册: 2012-04-30
- 专业: 人类遗传学
【答案】应助回帖
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容|
不建议您使用国产的康为世纪的bisulfite 转换试剂盒，我们的产品产品转化效率，比较好！具体请参考：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5965720&view=mp 如还有什么问题可以加我的Q1951545998 您是在北京做实验，还是说在外地呢？ |
4楼2014-02-24 16:23:15
