24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2871  |  回复: 6

lyl2ds

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助-基因克隆及引物设计的问题

我现在想克隆出一段基因,需要设计简并引物,我又7条序列通过clustal比对找出了保守区,想将这保守区的全长克隆出来,想请教下高人,帮我设计下简并引物!我是新手,请各位高人指教!
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : cDNA比对结果.txt
  • 2012-03-06 16:42:41, 15.85 K

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyl2ds

铜虫 (初入文坛)

还有问题,就是我认为的保守区是1-884,不知道是不是正确的,如果是正确的我想把1-884这段基因全长克隆出来,需要能克隆出全长的引物,我之前设计了一个,但是没P出来,想再重新设计个,请高人指教!
2楼2012-03-06 16:47:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

海阔天空8158

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+5): 呵呵,多谢支持 2012-03-09 09:38:31
兼并引物的设计有时候是很难得到引物的。
需要花费很长时间切胶,克隆,测序。
祝实验顺利。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
3楼2012-03-08 17:28:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

boshiyucun

新虫 (初入文坛)

简并引物并没有那么难,只是注意一下简并度不要太高,其他就按照一般引物的条件去设计就可以了,PCR时候可以设置一个温度TD基本都没有问题的!祝试验顺利!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-03-08 20:26:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyl2ds

铜虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by boshiyucun at 2012-03-08 20:26:42:
简并引物并没有那么难,只是注意一下简并度不要太高,其他就按照一般引物的条件去设计就可以了,PCR时候可以设置一个温度TD基本都没有问题的!祝试验顺利!

谢谢您!我又用P5设计了个引物,可是效果还是不好!您能帮我分析下原因吗
5楼2012-03-11 19:16:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyl2ds

铜虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by 海阔天空8158 at 2012-03-08 17:28:07:
兼并引物的设计有时候是很难得到引物的。
需要花费很长时间切胶,克隆,测序。
祝实验顺利。

谢谢,PT-pcr不出结果,怎么办
6楼2012-03-11 19:17:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

守望者047

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助,欢迎常来 2012-06-08 13:52:00
我们碰到的问题是一样的,所用的方法也是一样的,我要克隆的是某物种MHC的基因,您的第一步也是提取总的RNA和DNA吧,呵呵,我也在设计引物,准备以总RNA中相应的mRNA为模板RTPCR得到cDNA的第一条链,通过对7条其他物种MHC的mRNA的序列比对(用clustalx)找到了相对保守的序列,打算在5·端设计一个特异性引物,3·端先设计特异引物,不行就用Oligo(dT);另一方面,根据文献中给出的cDNA序列找到同源性较高的区段,重新设计引物,以总DNA为模板PCR,对扩增出来的片段和DNA模板进行测序。两者比较可以找到相应的外显子和内含子序列。我也是分子新手,不敢确定这样做到底对不对,但还是希望能帮到您。
数往者顺,知来者逆!
7楼2012-06-08 10:41:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lyl2ds 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 环境科学与工程334分求调剂 +9 王一一依依 2026-03-30 12/600 2026-04-04 20:55 by dongzh2009
[考研] 085601,一志愿厦大334复试被刷求调剂 +13 曾仰之 2026-04-03 15/750 2026-04-04 20:13 by dongzh2009
[考研] 一志愿华北电力大学(北京),材料科学与工程学硕265,求调剂 +11 yelck 2026-04-03 12/600 2026-04-04 19:52 by dongzh2009
[考研] 332求调剂 +10 Lyy930824@ 2026-03-29 10/500 2026-04-04 18:41 by macy2011
[考研] 329求调剂 +13 miaodesi 2026-04-02 15/750 2026-04-04 18:14 by jj987
[考研] 348分环境工程·调剂 +10 吴彦祖24k 2026-04-03 11/550 2026-04-04 14:19 by 无际的草原
[考研] 一志愿C9的化学工程(085602) 340分,感觉校内调剂无望,求调剂 +9 万事宜臻 2026-04-04 9/450 2026-04-04 11:49 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿北京科技大学材料工程085601,求调剂 +17 cdyw 2026-04-02 18/900 2026-04-04 11:14 by w_xuqing
[考研] 085600材料与化工调剂 +26 kikiki7 2026-03-30 27/1350 2026-04-04 09:18 by qlm5820
[考研] 考研调剂 +8 不爱喝饮料 2026-04-03 8/400 2026-04-03 16:40 by Mistake-J
[考研] 材料专硕322分 +13 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 13/650 2026-04-03 16:08 by 哦哦123
[考研] 071000生物学调剂 +8 知昭蔓 2026-04-02 8/400 2026-04-03 10:36 by macy2011
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-04-02 3/150 2026-04-03 08:44 by yulian1987
[考研] 求调剂!生物与医药专硕 +4 逆转陆先生 2026-04-01 5/250 2026-04-03 08:33 by Jaylen.
[考研] 346求调剂 +5 郑诚乐 2026-04-02 5/250 2026-04-02 16:38 by SZW_UJN
[考研] 318求调剂 +3 笃行致远. 2026-03-31 4/200 2026-04-02 15:56 by Jaylen.
[考研] 材料专硕322分 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 11/550 2026-04-02 10:52 by lnilvy
[考研] 326求调剂 +4 崽崽仔 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:58 by 我的船我的海
[考研] 土木304求调剂 +5 顶级擦擦 2026-03-31 5/250 2026-04-01 08:15 by fdcxdystjk¥
[考研] 070300化学专业279调剂 +10 哈哈哈^_^ 2026-03-31 10/500 2026-03-31 23:13 by liu823948201
信息提示
请填处理意见