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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 只知道重亚硫酸盐处理后的DNA序列的引物，怎么找到原目的序列呢？
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唐亦悠悠

金虫 (小有名气)

[交流] 只知道重亚硫酸盐处理后的DNA序列的引物，怎么找到原目的序列呢？ 已有1人参与

有关某基因甲基化的课题，用Pyrosequencing做，可是不知道目的序列，只知道目的片段的PCR引物，我该如何找目的序列呢？
求各位大侠指导一下子！
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1楼 2013-08-19 17:26:12
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yimingwang

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引物序列应该是非常特意的。所以，BLAST
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Let'sdoit.
2楼2013-08-19 17:58:37
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唐亦悠悠

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yimingwang at 2013-08-19 17:58:37
引物序列应该是非常特意的。所以，BLAST

引物都是针对重亚硫酸盐处理过的DNA，也就是原DNA序列里非甲基化的C处理后变成了U，BLAST出不来
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3楼2013-08-19 18:58:22
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yimingwang

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
呵呵，既然你知道U是C变得，那把U都变成C以后，Blast试下呢？
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Let'sdoit.
4楼2013-08-19 19:34:59
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