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唐亦悠悠

金虫 (小有名气)

[交流] 只知道重亚硫酸盐处理后的DNA序列的引物,怎么找到原目的序列呢? 已有1人参与

有关某基因甲基化的课题,用Pyrosequencing做,可是不知道目的序列,只知道目的片段的PCR引物,我该如何找目的序列呢?
求各位大侠指导一下子!
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yimingwang

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引物序列应该是非常特意的。所以,BLAST
Let'sdoit.
2楼2013-08-19 17:58:37
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唐亦悠悠

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yimingwang at 2013-08-19 17:58:37
引物序列应该是非常特意的。所以,BLAST

引物都是针对重亚硫酸盐处理过的DNA,也就是原DNA序列里非甲基化的C处理后变成了U,BLAST出不来
3楼2013-08-19 18:58:22
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yimingwang

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
呵呵,既然你知道U是C变得,那把U都变成C以后,Blast试下呢?
Let'sdoit.
4楼2013-08-19 19:34:59
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