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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 提基因组DNA遇到的问题，麻烦大家给帮忙看看
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农虫

金虫 (初入文坛)

[求助] 提基因组DNA遇到的问题，麻烦大家给帮忙看看 已有1人参与

这是我提病毒DNA基因组的电泳图，左右两次提的结果。用的是promega试剂盒，好像是提细菌的，但能提出病毒DNA来，我也就用了，MARKER是2000bp，想问一下，
1我提的质量怎么样，做酶切会不会有影响？
2下面的两条带是什么，提基因组怎么会有这样的带？

非常感谢！
提基因组DNA遇到的问题，麻烦大家给帮忙看看
2013-12-26-17-08-31.jpg
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1楼 2013-12-26 17:24:03
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农虫

金虫 (初入文坛)
我的病毒DNA是双链环状。病毒不含RNA。
之前用苯酚抽提，加无水乙醇后又白色的沉淀，但260/280还可以，260/230有点低。
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2楼2013-12-26 17:28:58
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三蛰

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
农虫: 金币+5, ★有帮助, 因为有事，跑胶的时间短了些。胶浓度不到1% 2013-12-27 11:19:01
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-28 20:54:51
建议你先做一块质量好点的胶，marker没跑开，我看如果跑开了，基因组提取的还行。
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我不会！
3楼2013-12-26 20:07:47
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
农虫(kx444555代发): 金币+4, 鼓励交流 2013-12-27 09:43:57
农虫: 金币+10, ★有帮助 2013-12-27 11:15:22
marker是DL2000???Marker跑不开确实无法判断，但是你的2,4,5,6,7泳道同你的marker比亮度不够，目测基因组浓度不高，你的胶是不是浓度太大了啊？
至于下面为什么是两条带，你刚才也说了你的病毒基因组是个双链环状DNA分子，那存在状态不就跟质粒没什么区别，一般这种环状双链DNA都会有超螺旋，开环，线性三种形式，这样你的条带会有3条大小不同的带，由于你的marker看不清，我不知道大小怎么，不过应该是对的，
其实我有个想法，你把你的病毒的衣壳给处理了后直接用提质粒试剂盒回收不就行了，如果担心你提的量不够，多提几管上一个柱子，直接就把浓度给加上去了。用试剂盒处理的纯度肯定是没问题的
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

农虫
大家相互帮助哈
4楼2013-12-26 21:54:59
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)
用过一次promega基因组中提试剂盒，样品太粘不能过柱，效果还不如TIANGEN小提中量试剂盒。
还是TIANGEN的试剂盒好用
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

农虫
5楼2013-12-27 09:48:58
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农虫

金虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2013-12-27 09:48:58
用过一次promega基因组中提试剂盒，样品太粘不能过柱，效果还不如TIANGEN小提中量试剂盒。
还是TIANGEN的试剂盒好用

我的好像是不用过柱子的。
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6楼2013-12-27 11:14:31
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农虫

金虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by luwei13566 at 2013-12-26 21:54:59
marker是DL2000???Marker跑不开确实无法判断，但是你的2,4,5,6,7泳道同你的marker比亮度不够，目测基因组浓度不高，你的胶是不是浓度太大了啊？
至于下面为什么是两条带，你刚才也说了你的病毒基因组是个双链环状D ...

恩， 浓度是不高。我的目的是做酶切，提DNA提了好长时间了，快崩溃了。病毒外壳怎么处理，就是去蛋白吗？我的DNA是核型多角体病毒。


急需求助。
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7楼2013-12-27 11:22:18
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luwei13566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 农虫 at 2013-12-27 11:22:18
恩， 浓度是不高。我的目的是做酶切，提DNA提了好长时间了，快崩溃了。病毒外壳怎么处理，就是去蛋白吗？我的DNA是核型多角体病毒。


急需求助。...

你是用的什么试剂盒提病毒基因组的？
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大家相互帮助哈
8楼2013-12-27 20:07:31
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不叶珏

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-28 20:55:12
gyesang: 回帖置顶 2013-12-28 20:55:23
基因组可以

下面的两条带是RNA 分别是28S 和 18S 加RnaseA 可去除
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农虫
借你一生好不好
9楼2013-12-27 21:00:55
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农虫

金虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by 不叶珏 at 2013-12-27 21:00:55
基因组可以

下面的两条带是RNA 分别是28S 和 18S 加RnaseA 可去除

我的病毒没有rna啊，从哪来的呢
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10楼2013-12-27 21:49:11
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