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hraikeyan

金虫 (小有名气)

[交流] 提的基因组，除了基因组还有两条带是什么？

大家看看我提的基因组，除了基因组条带，在1000bp左右还有两条带，这是什么呢？我提的时候没有加RNA酶，是不是RNA啊？

基因组.jpg
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1楼 2012-11-27 20:56:26
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hraikeyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liaoshibo at 2012-11-27 21:42:27
没有加RNA酶，RNA就会在最后提取的DNA中。所以不纯。下面的两条带可能是RNA.

一般不是RNA会自动降解吗？怎么还会有这么亮的条带？
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3楼2012-11-27 21:54:16
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hongyz

铁杆木虫 (正式写手)
★
hraikeyan(金币+1): 谢谢参与
很明显，下面所有带都是RNA。
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6楼2012-11-28 08:17:21
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hraikeyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liaoshibo at 2012-11-27 21:42:27
没有加RNA酶，RNA就会在最后提取的DNA中。所以不纯。下面的两条带可能是RNA.

我加RNA酶做了一次，条带确实消失了，是RNA，
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15楼2012-12-02 22:02:29
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
22楼: Originally posted by hraikeyan at 2012-12-06 13:13:22
这是我用RNA酶处理之后的基因组，两条带消失了，但在最下面聚集了亮带，我想主应该就是RNA了吧。

基因组 大量 2012.12.01.png
...

恩  
但是你以后做这样对比验证实验的时候加上对照，不加对照是不能完全说明问题的，很多情况你是无法预计和未知的！
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23楼2012-12-06 18:29:50
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普通回帖

liaoshibo

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
hraikeyan(金币+1): 谢谢参与
hraikeyan: 金币+2 2012-11-27 21:54:25
没有加RNA酶，RNA就会在最后提取的DNA中。所以不纯。下面的两条带可能是RNA.
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2楼2012-11-27 21:42:27
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问道有先后

新虫 (初入文坛)
★
hraikeyan(金币+1): 谢谢参与
我也认为是RNA的可能性最大
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4楼2012-11-27 22:24:08
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liaoshibo

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hraikeyan at 2012-11-27 21:54:16
一般不是RNA会自动降解吗？怎么还会有这么亮的条带？...

不加RNA酶怎么降解？你说的降解是指会自动降解影响含量。能彻底自动降解？没听说过。哪RNA酶有啥用？
DNA也会发生自动降解。
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5楼2012-11-27 23:15:24
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+1, 的确是RNA 2012-11-28 08:33:10
新鲜提取的DNA样品如果不加RNase消化电泳时可以看到明显的rRNA，正象楼主提的那样，下面的都是RNA。如果想等其自动降解，需要很长时间。还是用RNase处理一下吧。
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7楼2012-11-28 08:21:53
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xstarsky

铁杆木虫 (正式写手)
7楼正解
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8楼2012-11-28 09:12:38
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bupashibai

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我感觉不可能是RNA，条带这么亮且均一，怎么可能有这么有表达量这么高的RNA，并且咱一般提基因组不加RNase的话，RNA条带应该是分子量很小且连续的亮片。。。我觉得可能是提断的DNA吧
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9楼2012-11-28 09:37:46
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billtsu

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
下面条带的RNA提取的不错啊
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11楼2012-11-28 10:41:06
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weining1203

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
目测是RNA 楼主很强大啊
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12楼2012-11-28 11:29:52
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shapiaopiao

金虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
RNA一般在250 bp左右，看条带均一且亮，看菌种是不含有质粒啊
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13楼2012-11-28 15:28:06
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武佳丽

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也觉得不是RNA   基因组DNA 跑胶能看出明显的条带吗？应该是多大的条带都有吧？
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14楼2012-11-28 21:05:18
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我看也像RNA，如果是RNA，那LZ提取得很好啊！
LZ用RNA酶处理一下再跑电泳，看看到底是不是RNA！
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16楼2012-12-03 10:00:14
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雨季花开

银虫 (初入文坛)
像是降解的DNA
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17楼2012-12-05 21:26:38
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hraikeyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by wu_shiyong at 2012-12-03 10:00:14
我看也像RNA，如果是RNA，那LZ提取得很好啊！
LZ用RNA酶处理一下再跑电泳，看看到底是不是RNA！

加RNA后，条带确实消失了。
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18楼2012-12-05 21:32:23
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
18楼: Originally posted by hraikeyan at 2012-12-05 21:32:23
加RNA后，条带确实消失了。...

呵呵 看来妹子做实验比较严谨啊，提DNA都能把RNA弄成那样！
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19楼2012-12-06 11:37:14
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490599702

铜虫 (小有名气)
★
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降解哪有那么快。就是rna条带。
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21楼2012-12-06 12:20:41
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hraikeyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by wu_shiyong at 2012-12-03 10:00:14
我看也像RNA，如果是RNA，那LZ提取得很好啊！
LZ用RNA酶处理一下再跑电泳，看看到底是不是RNA！

这是我用RNA酶处理之后的基因组，两条带消失了，但在最下面聚集了亮带，我想主应该就是RNA了吧。

基因组 大量 2012.12.01.png
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22楼2012-12-06 13:13:22
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浮生、若梦

金虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
15楼: Originally posted by hraikeyan at 2012-12-02 22:02:29
我加RNA酶做了一次，条带确实消失了，是RNA，...

楼主你好，请问你是什么时候加的RNA酶，加的浓度和量分别是多少，谢谢
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24楼2013-04-16 18:56:00
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hraikeyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
24楼: Originally posted by 浮生、若梦 at 2013-04-16 18:56:00
楼主你好，请问你是什么时候加的RNA酶，加的浓度和量分别是多少，谢谢...

是在用溶菌酶处理1h后，和蛋白酶K同时加入一起处理30min，浓度时20ug/ml
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25楼2013-04-17 10:59:05
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yangjianchen

铜虫 (小有名气)
★
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你用的柱子提的吧？肯定是RNA。
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26楼2013-04-17 13:27:29
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hraikeyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
26楼: Originally posted by yangjianchen at 2013-04-17 13:27:29
你用的柱子提的吧？肯定是RNA。

不是，是自己配的溶液提的。CTAB法。
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27楼2013-04-17 17:05:04
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yangjianchen

铜虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
27楼: Originally posted by hraikeyan at 2013-04-17 17:05:04
不是，是自己配的溶液提的。CTAB法。...

一般提出来就只会在下面有一条模糊的带，是RNA降解的，出现两条这么亮的带的确很少见。
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28楼2013-04-17 19:50:58
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jiaoxiayoulu

新虫 (小有名气)
★
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我也出现这样的问题了，不过我是酵母基因组，出现了四条带，我之前也怀疑过是RNA，现在看了帖子，更加坑定了！我还有一种担心是我的除了基因组外还有三条带，我又有点怀疑是质粒！不过先做过RNase处理试试。。
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29楼2013-12-17 09:10:30
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梧桐柒夕

主管区长 (文坛精英)
★
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有一条是质粒。你RNA也没降解完。
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30楼2013-12-17 15:15:40
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tjufeixiang

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我觉得之前那两条带不会是RNA，RNA一般很小，会跑到最前边，，有一种可能是你提基因组的时候不注意，基因组发生了锻炼
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31楼2013-12-17 16:36:57
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ms757936

铁虫 (初入文坛)
★
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楼主这个问题只是加RNA酶就能解决吗？我用试剂盒提取蘑菇DNA，离心柱型，出现一模一样的问题
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32楼2014-07-02 21:59:38
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yuman0709

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我用试剂盒提的，为什么老是提不出来，一直都是两条带，都小于10000，怎搞？求大神帮忙啊！我还让别人帮我提了一次，结果还是一样！
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33楼2014-10-28 09:51:32
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简单回复
yyll198810楼
2012-11-28 10:25   回复  
RNA
haiman199120楼
2012-12-06 12:10   回复  
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