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henghengyouyou银虫 (正式写手)
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公布的基因组没有这个基因的注释,而用其他软件发现了这个基因,如何?
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如题,本人在做定位,在(高粱基因组)区间内发现一段序列( around 60kb)没有预测注释基因。 但是其他文章提到过这个区间至少有三个基因,他用softberry预测的,我也同样预测到了。我用NCBI做blast,也没发现有相关的已报道EST数据,可能是做的人非常的少,也可能其他原因。 但是之前发表文章的那个人确实做了这几个基因的表达,存在表达,但是那人没有克隆做功能鉴定,可能这段序列比较复杂。 现在疑问了,这几个基因到底存在不?基因组数据库好像不太可靠啊(估计只能试验验证)。 这三个基因的同源性特别高,转录方向相同,三个基因的的上、下游序列也是相似性很高,并且基因间发现有LTR原件,三个基因外的相同位置都发现了正向重复序列。请问,基因被转座了基因本身会发生变异么?转座子可以带着基因直接转座到相邻位置进行duplication不? 谢谢! |
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2楼2013-03-30 21:25:02
henghengyouyou
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3楼2013-03-31 00:36:01

4楼2013-03-31 12:20:13
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