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[交流]
为什么测得的序列在NCBI里blast不出来？
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求指点啊：我扩了A属（用的是A属下的单一种做的）的18S、28S和ITS(ITS1+5.8S+ITS2)这三段基因，得到序列后到NCBI里blast。 结果：18S比对出了A属的信息； 28S没有比对出A属，而是比对出B属的信息，已知A、B是一个科的 ITS blast后显示：No significant similarity found。 之前怀疑是测序出错，换公司把28S和ITS 重测之后，测序结果98%一致，当然blast结果也一样。 后又查文献，还没有明确找到A属有做28S和ITS的，B属做28S的很多。这三段基因在我所做的这个门、不同属都有做的，但每个属可能只做其中某几段（当然可能是我文献查的不全）。 鉴于我上述情况，求各位高手指点可能的原因是什么啊？ |
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neu2343楼
2013-12-05 09:34
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会飞的乌龟--5楼
2013-12-05 09:58
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haixiawu6楼
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wlxiao8楼
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hongdounv7710楼
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yiloutingyu12楼
2013-12-06 23:17
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