| 查看: 7135 | 回复: 13 | |||
[交流]
为什么测得的序列在NCBI里blast不出来？
|
|||
|
求指点啊：我扩了A属（用的是A属下的单一种做的）的18S、28S和ITS(ITS1+5.8S+ITS2)这三段基因，得到序列后到NCBI里blast。 结果：18S比对出了A属的信息； 28S没有比对出A属，而是比对出B属的信息，已知A、B是一个科的 ITS blast后显示：No significant similarity found。 之前怀疑是测序出错，换公司把28S和ITS 重测之后，测序结果98%一致，当然blast结果也一样。 后又查文献，还没有明确找到A属有做28S和ITS的，B属做28S的很多。这三段基因在我所做的这个门、不同属都有做的，但每个属可能只做其中某几段（当然可能是我文献查的不全）。 鉴于我上述情况，求各位高手指点可能的原因是什么啊？ |
回复此楼» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有144人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- SOS，求助，NCBI上引物比对问题
已经有6人回复
- NCBI在线Blast的图文说明
已经有13人回复
- 转录组测序后的序列在NCBI上BLAST后遇到的一些问题，求解答
已经有5人回复
- 在NCBI里搜索到a基因多条序列，如何确定该基因的序列？
已经有9人回复
- 关于T载体连接验证后测序不对
已经有3人回复
- 递交新序列到NCBI遇到的问题求解惑。
已经有4人回复
- NCBI序列比对问题
已经有6人回复
- Blast 细菌比对各种疑问，求解
已经有4人回复
- 求助 测序得到条带NCBI上没有同源序列
已经有8人回复
- NCBI BLAST的应用
已经有9人回复
- NCBI blast 序列比对遇到的问题
已经有4人回复
- 现在大家比对序列除了NCBI还有用哪些网站？
已经有11人回复
- 请问：NCBI Blast里得出的序列的 e value是什么意思？
已经有7人回复
- 想要设计引物 可是NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列 谢谢啊
已经有15人回复
- 用PCR扩增后的DNA如何测序？不能直接用PCR就知道是什么菌种之类的吧？
已经有6人回复
- 【教程】NCBI、blast相关教程
已经有233人回复
- 菜鸟求助——着急求助解答：在NCBI上为什么下载不了FASTA格式的基因序列
已经有9人回复
- NCBI中的BLAST使用
已经有12人回复
- NCBI中新序列的登录号怎么获取？
已经有9人回复
- 【求助/交流】怎样提交序列到NCBI上
已经有9人回复
- 【求助/交流】请问，有没有谁知道，如何从NCBI上批量下载一类gene的核苷酸序列？
已经有13人回复
- NCBI blast 结果一些参数的含义求高手指点
已经有12人回复
- 【分享】 在NCBI上使用BLAST等工具的心得【已搜索无重复】
已经有58人回复
4楼2013-12-05 09:40:41
2楼2013-12-05 09:09:57
7楼2013-12-05 10:05:44
9楼2013-12-05 10:32:05
11楼2013-12-05 17:59:37
13楼2018-04-15 00:08:32
14楼2018-04-15 00:09:44
简单回复
neu2343楼
2013-12-05 09:34
回复
柠檬可乐星(金币+1): 谢谢参与
会飞的乌龟--5楼
2013-12-05 09:58
回复
柠檬可乐星(金币+1): 谢谢参与
haixiawu6楼
2013-12-05 10:00
回复
柠檬可乐星(金币+1): 谢谢参与
wlxiao8楼
2013-12-05 10:10
回复
柠檬可乐星(金币+1): 谢谢参与
hongdounv7710楼
2013-12-05 10:53
回复
柠檬可乐星(金币+1): 谢谢参与
1 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
yiloutingyu12楼
2013-12-06 23:17
回复
柠檬可乐星(金币+1): 谢谢参与
20