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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » NCBI中新序列的登录号怎么获取？
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tuobaohua

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[求助] NCBI中新序列的登录号怎么获取？

新测序得到一段16S rRNA序列，看到外文文献中都有自己所测序列在NCBI中的登录号。自己也尝试着按照百度里面别人提供的方法试了一下，由于描述太简单，还是没有成功，不知道该怎样操作。
本人为分子新手，劳烦各位高手帮帮忙，教教我怎样去获得这个accession number。

不胜感激啊！！
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1楼 2011-05-31 09:03:22
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andy99990000

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-05-31 11:09:22
tuobaohua(金币+4): 是哪个软件？能否给个链接，NCBI的主页上那么多东西，我还真不知道点哪个开始。期待回复，非常谢谢哈！ 2011-05-31 16:55:16
其实就是用NCBI自带的那个软件，一步步按照它的指引填入你的信息，我记得有文章名，作者，学校，等等吧。然后就是粘贴上你的序列，可以一次多序列上传，最后生成一个提交文件，然后将这个文件用你文章通讯作者的邮箱发到NCBI的新序列接收那个地址。大概1-2周后，他们就会把所有你提交的序列accession number发给你了，一般是顺号的。

有一点要额外注意，在生成那个提交文件的时候，会有一个复选框问你何时准备公布你的序列信息，这个按你老板的意思去填，一般会保留信息1年左右再公布，这样实验室后续实验便不会受太多外界的影响。

个人经验，希望有所帮助~~
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2楼2011-05-31 10:44:30
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西瓜

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★ ★ ★ ★ ★
1949stone(金币+5): good 2011-06-05 16:15:14
NCBI上提交序列有好几种方法，这个页面有说明：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/submit.html

不想下软件的话，也可以直接用BankIt从网页提交：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/?tool=genbank
BankIt: Submitting Via the WWW
NCBI has developed a WWW form, called BankIt, for convenient and quick submission of sequence data.
   BankIt allows you to enter sequence information into a form, edit as necessary, and add biological annotation (e.g., coding regions, mRNA features). BankIt transforms your data into GenBank format for your review and when your record is completed, it can be submitted directly to GenBank. You have the option of adding information by using text boxes to describe in your own words the source of the sequence and its biological features. The GenBank annotation staff reviews the submitted textual information, incorporates it into the appropriate structured fields, and returns the record by e-mail for your review.
   BankIt is compatible with Netscape clients for Unix, Macs, and PCs. In addition, Internet Explorer for the PC and Mac have successfully been used.
使用前需要注册（点击右上角的“Sign in to use BankIt”）。

然后NCBI还提供了个The GenBank Submissions Handbook，里面有更多关于如何提交序列的说明，可以看看：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK51157/
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tuobaohua
3楼2011-06-05 09:11:29
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tuobaohua

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1949stone: 没问题的 版主都是很热心的 只要能帮到你 就很高兴了 2011-06-05 16:16:06
引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-06-05 09:11:29:
NCBI上提交序列有好几种方法，这个页面有说明：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/submit.html

不想下软件的话，也可以直接用BankIt从网页提交：
[url]http://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/? ...

非常谢谢！
放了好几天，就一个人回复我，所以上午的时候刚提交斑竹，让他关闭这个求助，所以现在没法给你赠送金币了。只能送一朵红花代替了，包涵哈
你的回复对我很有帮助！！
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4楼2011-06-05 15:50:09
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西瓜

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1949stone: 这是我的回复：没问题的 版主都是很热心的 只要能帮到你 就很高兴了 2011-06-05 21:35:23
引用回帖:
Originally posted by tuobaohua at 2011-06-05 15:50:09:
非常谢谢！
放了好几天，就一个人回复我，所以上午的时候刚提交斑竹，让他关闭这个求助，所以现在没法给你赠送金币了。只能送一朵红花代替了，包涵哈
你的回复对我很有帮助！！

哈哈，你发帖那几天我有事都没怎么上来，偶然有点时间都去评贴了，所以都木有回帖……。
对你有帮助就好，金币什么都浮云啦
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tuobaohua
5楼2011-06-05 18:21:40
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tuobaohua

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引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-06-05 18:21:40:
哈哈，你发帖那几天我有事都没怎么上来，偶然有点时间都去评贴了，所以都木有回帖……。
对你有帮助就好，金币什么都浮云啦

嗯，非常谢谢，后来我仔细的找，终于找到了，嘿嘿
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6楼2011-06-06 08:19:30
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张宇飞enjoy

新虫 (初入文坛)
不错
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7楼2012-02-22 18:24:13
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tuobaohua

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7楼: Originally posted by 张宇飞enjoy at 2012-02-22 18:24:13:
不错

在NCBI主页上下载个sequin软件
打开你自然就会用了
还有一种就是在线上传序列的，我没用过
我觉得离线的挺好用的
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8楼2012-02-23 07:42:52
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srzh1221

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
531540楼: Originally posted by andy99990000 at 2011-05-31 10:44:30
其实就是用NCBI自带的那个软件，一步步按照它的指引填入你的信息，我记得有文章名，作者，学校，等等吧。然后就是粘贴上你的序列，可以一次多序列上传，最后生成一个提交文件，然后将这个文件用你文章通讯作者的邮箱 ...

具体怎么操作呀，弱弱的问下该怎么操作呢？麻烦详细下吧。
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9楼2012-11-06 20:57:21
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srzh1221

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
742126楼: Originally posted by 西瓜 at 2011-06-05 09:11:29
NCBI上提交序列有好几种方法，这个页面有说明：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/submit.html

不想下软件的话，也可以直接用BankIt从网页提交：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/?tool=genbank
Bank ...

我怎么下载不下来呀，麻烦指点呀，非常感谢。
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10楼2012-11-06 20:58:12
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