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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » NCBI blast 序列比对遇到的问题
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0700901104

金虫 (初入文坛)

[求助] NCBI blast 序列比对遇到的问题

我的一个基因长度500多bp，拿去NCBI 比对一下出现一下的结果，只有后面300bp-500bp能比对的上 前面的序列为何比对不上？ 基因也算是同一个基因 我都不敢进行设计引物了 麻烦各位高手指点一下

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别爱的太迟，别忽略了亲情，别什么都没了才后悔！
1楼2013-01-21 14:23:11
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郑顺利

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
那重新扩一次，重新测下序看看
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努力过才不会留太多的遗憾
2楼2013-01-21 15:12:22
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gaoyg

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
做Blast需要自己选定比对的数据库，你换几个数据库重新做一下比对可能有帮助
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3楼2013-01-23 13:22:12
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616057157

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
个人认为，你应该测序，看看你的目的基因是否全部扩增出来，跑一下电泳或PCR、酶切等初步验证一下
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不曾拥有何谈失去，不必伤心！！！
4楼2013-01-23 13:48:07
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wuping880315

木虫 (著名写手)

折翼的天使

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有可能你扩出来的基因是突变后的基因，如果是，恭喜你！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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生命中多少次的挫折才能成就一次伟大！
5楼2013-01-24 11:05:42
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