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yuyang031985

金虫 (正式写手)

[求助] 请教Western blot问题 已有1人参与

最近在做Western blot,提取耐药细胞的p-gp蛋白,文献报道理论分子量170kd,我们跑出来的分子量130kd左右,而且还不确定是不是该条带,请高人指点哪里有可能出问题??

已使用过的抗体:Abcam的p-gp抗体(兔抗、鼠抗都用过);博士德的p-gp抗体
胶的浓度:6%、8%、10%和12%都使用过;
裂解液:碧云天的强、中强、弱的裂解液都试过;
提蛋白的方法:总蛋白和膜蛋白的提取都尝试过;
使用的膜:0.22微米的PVDF膜
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hongyongbo

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
该蛋白是否有亚基,在提取纯化过程中降解导致少了40KD
2楼2013-08-07 21:08:26
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hongyongbo

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

还要考虑下可变剪切
3楼2013-08-07 21:09:04
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biowandy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请问具体蛋白是什么名字?可以上uniprot研究下蛋白特性,
4楼2013-08-07 21:59:09
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jiang701820

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
改蛋白是否还有其他修饰,我之前也有过这样的经历,文献报道在120kDa,但是我做出来始终在56kDa,而且我买的抗体说明书上也是写的56kDa,这些抗体做出来再120kDa也没有条带,后来查了文献发现这个蛋白存在糖基化,糖基化后分子量会达到120kDa,所以你可以查一下你现在这个蛋白的氨基酸序列,算一下大概有多少Kda,如果说氨基酸序列算出来有170kDa的话,那可能你的实验确实存在一定问题,考虑换其他公司的抗体,另外建议用0.45uM的PVDF膜,因为该蛋白的分子量比较大。如果氨基酸序列算出来的分子量在130kDa左右的话可能是该蛋白存在其他修饰。
5楼2013-08-07 22:09:32
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yuyang031985

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jiang701820 at 2013-08-07 22:09:32
改蛋白是否还有其他修饰,我之前也有过这样的经历,文献报道在120kDa,但是我做出来始终在56kDa,而且我买的抗体说明书上也是写的56kDa,这些抗体做出来再120kDa也没有条带,后来查了文献发现这个蛋白存在糖基化,糖 ...

非常感谢,我们试试看行不行
说说你不开心的事让我们开心一下哈!
6楼2013-08-08 17:05:17
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yuyang031985

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by biowandy at 2013-08-07 21:59:09
请问具体蛋白是什么名字?可以上uniprot研究下蛋白特性,

蛋白就是叫P-gp膜蛋白
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7楼2013-08-08 17:05:42
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yuyang031985

金虫 (正式写手)

比较奇怪的是,我们参考文献里的方法,操作步骤什么的基本上都差不多,不同的地方有:
1)有用NC膜的,我们用的是0.22的PVDF膜;
2)抗体不一样,但也有文献用我们选的抗体做出来的;
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8楼2013-08-08 17:07:57
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酷哥哥1990

金虫 (小有名气)

我也是做耐药细胞中P-糖蛋白表达的,也遇到了和你一样的问题。。。。请问你这个问题解决了吗?还有就是膜蛋白你是怎么提取的?
9楼2014-02-24 14:40:06
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jiaolong11a

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

有的蛋白可能有亚型,你具体看看啥情况
多情总被无情扰。。。愁
10楼2014-02-24 14:56:29
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