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yuyang031985

金虫 (正式写手)

[求助] 请教Western blot问题 已有1人参与

最近在做Western blot,提取耐药细胞的p-gp蛋白,文献报道理论分子量170kd,我们跑出来的分子量130kd左右,而且还不确定是不是该条带,请高人指点哪里有可能出问题??

已使用过的抗体:Abcam的p-gp抗体(兔抗、鼠抗都用过);博士德的p-gp抗体
胶的浓度:6%、8%、10%和12%都使用过;
裂解液:碧云天的强、中强、弱的裂解液都试过;
提蛋白的方法:总蛋白和膜蛋白的提取都尝试过;
使用的膜:0.22微米的PVDF膜
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hongyongbo

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

还要考虑下可变剪切
3楼2013-08-07 21:09:04
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hongyongbo

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
该蛋白是否有亚基,在提取纯化过程中降解导致少了40KD
2楼2013-08-07 21:08:26
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biowandy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请问具体蛋白是什么名字?可以上uniprot研究下蛋白特性,
4楼2013-08-07 21:59:09
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jiang701820

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
改蛋白是否还有其他修饰,我之前也有过这样的经历,文献报道在120kDa,但是我做出来始终在56kDa,而且我买的抗体说明书上也是写的56kDa,这些抗体做出来再120kDa也没有条带,后来查了文献发现这个蛋白存在糖基化,糖基化后分子量会达到120kDa,所以你可以查一下你现在这个蛋白的氨基酸序列,算一下大概有多少Kda,如果说氨基酸序列算出来有170kDa的话,那可能你的实验确实存在一定问题,考虑换其他公司的抗体,另外建议用0.45uM的PVDF膜,因为该蛋白的分子量比较大。如果氨基酸序列算出来的分子量在130kDa左右的话可能是该蛋白存在其他修饰。
5楼2013-08-07 22:09:32
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