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7baby1990

新虫 (初入文坛)

[求助] pcr扩增后的电泳图为什么是这个样子?该如何改进

目的片段大概在1500左右

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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
7baby1990: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-05-05 12:33:19
myprayer: 金币+1, 真的很感激你。。。。。 2013-05-05 20:58:35
你的PCR结果电泳拖尾,可能是非特异性扩增多,即出现非特异性扩增带。也就是:PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带 与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、 或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数 过多有关。其次是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶 则不出现,酶量过多有时也会出现非特异性扩增。
其对策有:首先可以提高镁离子的浓度, 由1.0mmol/L起以0.05mmol/L为单位逐渐上升,最高不超过10.0mmol/L。提高镁离子的浓度无效的话,调整引物浓度(你的PCR结果电泳拖尾,可能是非特异性扩增多,因此应适当降低引物浓度),适当增加模板量,减少循环次 数。减低酶量或调换另一来源的酶。适当提高退火温度。以上都不行则要重新设计引物。每种调整均可以分梯度进行。
10楼2013-05-05 12:23:36
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用什么模板P的?感觉就是模板加多了,出现模板DNA的背景。
4楼2013-05-05 02:41:46
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意孤城_

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
7baby1990: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-05-05 12:13:45
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-06 02:22:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by 7baby1990 at 2013-05-04 20:45:51
MAKER是2000的...

2000maker?,如果目的条带出来了就不用care这些杂带(除非你是做定量PCR),杂带只能说明你的引物不特异。这是很正常也很常见的问题。
6楼2013-05-05 11:32:55
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dmtxbb

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
7baby1990: 金币+1, 有帮助 2013-05-05 12:15:01
正常,降低下退火温度,或者mg2+浓度应该就会好
7楼2013-05-05 11:43:03
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普通回帖

意孤城_

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
7baby1990(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-05-05 10:21:59
maker是多大啊?每条带多少?那个应该对应目的条带?说清楚啊
2楼2013-05-04 20:34:16
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7baby1990

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 意孤城_ at 2013-05-04 20:34:16
maker是多大啊?每条带多少?那个应该对应目的条带?说清楚啊

MAKER是2000的
3楼2013-05-04 20:45:51
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up-to-toper

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物版块期待你的更多精彩。 2013-05-05 10:22:23
7baby1990: 金币+1, 有帮助 2013-05-05 12:14:14
条带的拖尾现象严重,不是说明有非特异性扩增嘛?但是前面出现那么多阴影部分是什么原因就不知道了。总之我是个菜鸟,是进来讨论学习的
5楼2013-05-05 08:41:39
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7baby1990

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by up-to-toper at 2013-05-05 08:41:39
条带的拖尾现象严重,不是说明有非特异性扩增嘛?但是前面出现那么多阴影部分是什么原因就不知道了。总之我是个菜鸟,是进来讨论学习的

同菜鸟
8楼2013-05-05 12:14:38
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7baby1990

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-05-05 02:41:46
用什么模板P的?感觉就是模板加多了,出现模板DNA的背景。

模板就是鱼肉中分离出的细菌的DNA
9楼2013-05-05 12:16:09
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