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zhuqinjian

金虫 (小有名气)

[求助] SaII和BamHI双酶切切不开

我用T载体与目的片段连接后,导入JM109中,用菌落PCR也能P出目的片段,提取质粒后PCR也能P出来,电泳跑出来的片段也正确(环状片段跑出来有3条带),但是用SaII和BamHI双酶切就是切不出来,只有一条带。求大神指导啊?是不是只是单酶切了啊?为啥双酶切切不出来呢?
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gongeleven

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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zhuqinjian: 金币+5, 有帮助, 的确是这样的,我考虑重新连T载体再做一下,然后再送去测序 2013-05-02 11:03:49
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-02 12:01:38
gyesang: 回帖置顶 2013-05-02 12:01:46
用载体上的引物对插入片段测序,最靠谱
4楼2013-05-02 11:01:08
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8601

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhuqinjian: 金币+6, ★★★很有帮助, 有可能是这个原因,现在还在试一次 2013-05-03 09:13:09
zhuqinjian(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助!SalI确实不好用,不管是哪个公司的! 2013-05-03 20:22:59
gyesang: 回帖置顶 2013-05-03 20:23:11
SalI 这个酶感觉活性不如其他酶。 可能你的DNA里面有些杂质,抑制了SalI的活性。我曾经遇到过这样的情况,做了几个miniprep, 用bamHI 和 XhoI 都能切开,用SalI 时有的能全部切开,有时只有很微弱的带子,有的压根切不开。如果你非要用SalI,建议你先做下乙醇沉淀 (记得要加糖原),这样DNA会比较干净,比较容易被切开。
7楼2013-05-03 06:40:07
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

冰封之real

银虫 (初入文坛)

我也遇到过类似情况。你可以检查一下用的buffer是否合适,有些酶虽然可以与其他酶作双酶切,但在共同buffer里面活性会降低。我建议你可以分步酶切一下试试,虽然麻烦,但酶切效果好
13楼2013-05-07 09:18:41
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普通回帖

stevenshi021

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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zhuqinjian: 金币+5, 有帮助, 单酶切做了下,发现Sal I没有切开,哎不知道怎么回事 2013-05-02 11:01:09
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-02 12:01:23
分别做单切,确定是那个酶不能工作!此外,PCR的鉴定时候是否有加入阴性与阳性对照,我想担心你所看到的片段是都就是目的片段!希望对你有用!
2楼2013-05-02 10:20:52
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dafeizizhu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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zhuqinjian: 金币+3, 有帮助, 我是用捷瑞的试剂盒提的质粒,我觉得应该不是这个问题吧 2013-05-02 11:02:21
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-02 12:01:31
酶切之前,样品质粒要进行除酶,除盐,除乙醇等处理。一般就是酚氯仿抽提,技术要过关,不要在后面醇沉时留下太多的乙醇。上面说的单酶切验证酶是否失效是可行的,但是样品必须干净。内切酶很受离子和乙醇等物质影响的。
3楼2013-05-02 10:50:02
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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zhuqinjian: 金币+5, ★★★很有帮助, 恩,也有可能捷瑞引物合成的问题,再做一次看看,然后送去测序 2013-05-02 14:00:49
4楼说的对,你把T载体送去测序,看看这两个酶切位点的合成是否有误,有时候问题也有可能会出现在引物合成上,给酶切位点序列给合成突变掉了
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-05-02 12:02:56
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bolysu

禁虫 (著名写手)

★ ★ ★
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zhuqinjian(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-02 21:55:11
zhuqinjian: 金币+2, 有帮助, 应该不是这个原因,因为质粒条带很亮 2013-05-03 09:11:13
本帖内容被屏蔽

6楼2013-05-02 21:16:10
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chenyuqin

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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zhuqinjian: 金币+1, 有帮助 2013-05-03 11:17:13
考虑下有没有甲基化位点??如果有的话要换无甲基化酶的菌株
where there is a will,there ia a way.
8楼2013-05-03 09:25:18
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zhuqinjian

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by chenyuqin at 2013-05-03 09:25:18
考虑下有没有甲基化位点??如果有的话要换无甲基化酶的菌株

我是用的JM109,这个菌株貌似很少有甲基化的现象吧
坚定方向,坚持下去
9楼2013-05-03 11:16:49
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sd3824289

木虫 (正式写手)


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-04 19:30:01
4楼的方法挺好的,先用PCR方法确定一下有没有插入片段,在进行质粒酶切。如果切不开,可以适当延长一下酶切时间试一下!
坚持,就像流星,即使知道最后的结果,也要勇敢的走到最后!
10楼2013-05-04 10:24:26
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