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基因克隆失败原因,求助!
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陈彦利
铁虫
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(幼儿园)
金币: 8.9
帖子: 140
在线: 71.4小时
虫号: 2174654
[交流]
基因克隆失败原因,求助!
我们要克隆一个目的基因,结果PCR后电泳根本就没有条带,为什么呀,请高手帮忙分析原因
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1楼
2013-04-27 14:40:22
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陈彦利
铁虫
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虫号: 2174654
引用回帖:
3楼
:
Originally posted by
德国工兵铲
at 2013-04-27 14:54:01
体系中模板、引物、dntp、水都有可能有问题,还有镁离子浓度
程序中退火温度也比较重要,你什么都没有给,不好说啊!
以反转录得到的双链cDNA为模板,设计特异性引物,Forward primer:5’-GGCATCCATGTCGCATCTGT-3’;Reverse primer :5’-TCTGACCCTATTGAGCCCTCT-3’。通过PCR扩增获得目的基因OspHT7。
取0.5ml PCR管,一次加入下列试剂:
反应体系 25uL
Tamplate cDNA 0.75uL
ddH2O 16.5uL
10×PCR Buffer 2.5uL
Mg2+ 1uL
dNTP 2uL
primer Forward 1uL
Reverse 1uL
Taq 0.25uL
设定PCR程序:
PCR循环:
94℃ 预变性5min
94℃ 60s
55℃ 60s 30个循环
72℃ 90s
72℃ 10min
4℃ 保存。
电泳鉴定:采用1%的琼脂糖凝胶电泳进行分析,其中电泳加样体积均为10uLDNAMarker为D2000。紫外灯下观察结果。
拍照观察:采用凝胶图像分析系统,对电泳图条带进行拍照分析。
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6楼
2013-04-27 15:13:19
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cicelyzh
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★ ★ ★
陈彦利(金币+1): 谢谢参与
陈彦利(gyesang代发): 金币+2, 鼓励发贴交流,为楼主问题解决提供可能的线索!
2013-04-27 15:08:55
从什么模板克隆,基因组还是cDNA?模板是否有问题,PCR是否设置了正对照?引物的退火温度是否进行了优化?
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2楼
2013-04-27 14:50:06
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德国工兵铲
金虫
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金币: 894.4
帖子: 168
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虫号: 581720
★ ★
陈彦利(金币+1): 谢谢参与
陈彦利(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖交流!
2013-04-27 15:09:07
体系中模板、引物、dntp、水都有可能有问题,还有镁离子浓度
程序中退火温度也比较重要,你什么都没有给,不好说啊!
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3楼
2013-04-27 14:54:01
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我很快乐3A87
新虫
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在线: 24.8小时
虫号: 2418777
★
陈彦利(金币+1): 谢谢参与
我最近也正在做3'race,跑了好几次也没结果,好像最后都只是引物二聚体。maker本来应该点2000bp的,结果点错了点成15000的,目的片段本应该是400-500bp,请各位高手帮我分析分析这个电泳图,谢了。
B1[LMTHM4J4PP%}5_Y7BJ[8.jpg
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4楼
2013-04-27 15:11:25
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