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小木虫论坛-学术科研互动平台» 网络生活区» 有奖问答 » 有奖问答完结子版 » 【求助】求教基因克隆中的引物设计问题【有效期至2010年11月18日】
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yjb3344

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求教基因克隆中的引物设计问题【有效期至2010年11月18日】

从NCBI上获得一物种X基因序列，要根据该基因序列克隆另一物种的X基因全长序列，应该怎么设计引物？
需不需要比对根据保守序列设计？还是直接在编码区设？
要是做SNPs的分析，特异性引物又该怎么设？
问的有点多且乱，望知道的大虾不吝赐教，谢谢！

附注：引物的设计原则之类的不用在回答了，只需要一个尽可能详细的过程和方法，如果好用，全部金币奉上！
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不论在世界的任何角落·都要感到幸福
1楼 2010-10-08 16:28:09
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your2007

至尊木虫 (著名写手)
yjb3344(金币+2, 博学EPI+1):谢谢，能不能再详细点呀 2010-10-08 20:27:27
可以比对保守区设计引物，然后做3·，5·race
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爱人者被爱，敬人者人敬
2楼2010-10-08 19:31:30
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your2007

至尊木虫 (著名写手)
yjb3344(金币+2):Thanks! 2010-10-09 08:21:56
给你发篇相关的文献吧，这篇是在很有影响力的杂志--development上发表的，希望对你有帮助，https://www.namipan.com/d/Neverl ... 74a0c0953081cc21500
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爱人者被爱，敬人者人敬
3楼2010-10-08 21:23:57
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王会征

铁杆木虫 (著名写手)
yjb3344(金币+2):全长引物应该怎么设计啊？ 2010-10-10 14:07:59
因为物种不一样所以根据一个物种的序列设计全长引物去扩另一个物种的话很有可能扩不出，毕竟物种之间序列存在差异是很正常的。不过可以试一下，直接设计全长引物。不行的话可以尽可能多下载一些相关序列做同源比较设计保守区引物或兼并引物进行扩增，再用Race或染色体步移方法扩增全长。
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4楼2010-10-09 21:56:25
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王会征

铁杆木虫 (著名写手)
yjb3344(金币+2):特异性引物的设计一般设几个比较合适？多长片段设一个？ 2010-10-10 14:08:50
SNPs的分析，特异性引物的设计就要把类似物种的序列下载后同源分析找出保守区进行设计了。
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5楼2010-10-09 21:58:09
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yjb3344

木虫 (正式写手)
感谢各位虫虫的支持，可惜还是没能给我详尽的答案！就此结贴！
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不论在世界的任何角落·都要感到幸福
6楼2010-11-20 10:07:16
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vickie20

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
930762楼: Originally posted by your2007 at 2010-10-08 21:23:57:
给你发篇相关的文献吧，这篇是在很有影响力的杂志--development上发表的，希望对你有帮助，https://www.namipan.com/d/Neverland%20is%20an%20evolutionally%20conserved%20Rieske-domain.pdf/e671b35d3354cfa4236 ...

你给的链接有问题哎
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7楼2012-04-21 15:56:52
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