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相对定量内参基因的Ct值
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lixilei1314
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[交流]
相对定量内参基因的Ct值
1,请教各位,我最近在做荧光定量,一直在纠结一个问题。就是要不要调整mRNA的初始浓度,让最终荧光定量结果的内参基因Actin的Ct值在各个组织中相差不大(貌似最好小于1个循环)?理论上应该是各个组织中Actin的Ct值时相似的吧。
2,小弟都已经做完了,当时没考虑这个问题,做出来的结果,发现Actin的Ct值在各个组织中差异挺大的,最大都到5个循环左右了。现在才又考虑到这个问题了。纠结死了。这样的结果可能会有一定的影响,但还能用不?
请各位不吝赐教!
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2012-07-27 12:50:23
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vickie20
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4楼
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Originally posted by
decloud
at 2012-07-30 13:37:11
RNA怎么调一致啊,,我都是用nano测得浓度,然后用0.5ug逆转录,结果很悲催的,PCR内参ct差3,,,,...
我先测下浓度,然后再跑胶调亮度,测OD我感觉不靠谱,还是跑胶比较靠谱
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5楼
2012-07-30 15:21:02
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vickie20
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2012-07-30 09:00:40
有的人说,RNA最好调一致再做定量,有的说反正做的是相对定量不需要调,这个……我也在纠结中。不过我老师让我把RNA调一致了再做。还有一个说法是,单个内参在各组织各时期并不是总是很稳定,所以要用两个内参……
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2楼
2012-07-28 10:43:35
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lixilei1314: 金币+2
2012-08-21 17:06:02
如果是在国内发表文章,一般用一个内参就可以,内参在各个组有差异不会有什么影响。但是,若要在国外期刊发表需要做两个内参,并且这两个内参得到的最终结果不能差距太大。
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3楼
2012-07-28 16:27:08
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decloud
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2楼
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Originally posted by
vickie20
at 2012-07-27 14:43:35
有的人说,RNA最好调一致再做定量,有的说反正做的是相对定量不需要调,这个……我也在纠结中。不过我老师让我把RNA调一致了再做。还有一个说法是,单个内参在各组织各时期并不是总是很稳定,所以要用两个内参……
RNA怎么调一致啊,,我都是用nano测得浓度,然后用0.5ug逆转录,结果很悲催的,PCR内参ct差3,,,,
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4楼
2012-07-30 13:37:11
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