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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 荧光定量数据分析
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bayu18

新虫 (正式写手)

[求助] 荧光定量数据分析 已有2人参与

我现在做荧光定量PCR，得到下面的数据（CK、1、2代表不同植株）：
                  CK-1                  CK-2            CK-3                                1--1                        1--2                         1--3                  2--1              2--2                     2--3
内参基因        24.34666667          24.23        24.47666667        24.77333333        24.76333333        24.94333333           25.05        24.93333333        24.80333333
目的基因    39.14                 39.7        37.73                   36.8                          36.83                  37.31          38.16               N/A                        38.72
我是个新手，看很多人说CT值不要大于35，有的说37，是不是我得到的数据不可信啊？我下面该怎么做？谢谢！！！
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1楼 2014-01-13 20:48:08
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by bayu18 at 2014-01-14 10:16:12
对照CT是我做了很多重复选的三个数，其它的基本上都是N/A，是因为这个基因表达量非常低的原因么？...

可能在你取材这个时期或者这一组织表达量低
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hehe
6楼2014-01-14 10:25:04
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普通回帖

lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-01-14 08:33:08
数据还可以，你的基因表达本来就少CT值过大也没办法。顶多你反转时提高些RNA量，但估计也改变不了多少。
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hehe
2楼2014-01-13 21:29:55
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bayu18

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-13 21:29:55
数据还可以，你的基因表达本来就少CT值过大也没办法。顶多你反转时提高些RNA量，但估计也改变不了多少。

从哪里看出来我的基因表达本来少，CT值？
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3楼2014-01-14 08:40:16
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
bayu18: 金币+1, ★有帮助 2014-01-14 13:07:28
引用回帖:
3楼: Originally posted by bayu18 at 2014-01-14 08:40:16
从哪里看出来我的基因表达本来少，CT值？...

你对照CT都在37以上，相比你的管家基因表达量。
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hehe
4楼2014-01-14 08:44:50
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bayu18

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-14 08:44:50
你对照CT都在37以上，相比你的管家基因表达量。...

对照CT是我做了很多重复选的三个数，其它的基本上都是N/A，是因为这个基因表达量非常低的原因么？
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5楼2014-01-14 10:16:12
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double可

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
bayu18: 金币+1, ★有帮助 2014-01-14 13:17:55
内参值太大了，加大循环数过增加cDNA
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早已不承认还有什么神
7楼2014-01-14 12:46:15
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bayu18

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-14 10:25:04
可能在你取材这个时期或者这一组织表达量低...

那我的这个结果可用么？
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8楼2014-01-14 13:03:55
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bayu18

新虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by double可 at 2014-01-14 12:46:15
内参值太大了，加大循环数过增加cDNA

我用的20微升的体系，cDNA的量是50ng,师姐说内参值可以啊。一般认为内参值多少合适？CT值范围一般多少可信啊？
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9楼2014-01-14 13:07:15
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double可

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by bayu18 at 2014-01-14 13:07:15
我用的20微升的体系，cDNA的量是50ng,师姐说内参值可以啊。一般认为内参值多少合适？CT值范围一般多少可信啊？...

我们做的时候内参值一般20左右，你的目地基因值有点大，一般不超过35左右
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早已不承认还有什么神
10楼2014-01-14 13:10:50
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