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dongfangzz

银虫 (小有名气)

[求助] 荧光定量PCR(相对定量)的分析结果2-△△Ct怎么看呀?

荧光定量PCR(相对定量)的分析结果2-△△Ct怎么看呀?

组别                2-△△Ct(目的基因)
对照组                     1
实验组1            1.505
实验组2                0.246
以上结果怎么判断呢?能认为实验组1的表达比对照组高,实验组2 的表达比对照组低吗?
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dongfangzz(金币+3): 2011-04-22 16:37:32
dhd997(金币+5, EPI+1): good 2011-04-23 13:24:57
小木虫: 金币+2, 帖子真精彩 2014-03-06 10:05:06
引用回帖:
Originally posted by dongfangzz at 2011-04-22 15:08:08:
荧光定量PCR(相对定量)的分析结果2-△△Ct怎么看呀?

组别                2-△△Ct(目的基因)
对照组                     1
实验组1            1.505
实验组2                0.246
以上结果怎么判断呢 ...

如2楼所言,  2^-△△Ct结果就是这么看的。

由Ct值用2^-△△Ct法计算计算表达量差异的原理,可以看下面的图片:









附件的Excel文件是计算用的,感兴趣也可以看看由Ct值是如何一步一步算出2^-△△Ct的。

[ Last edited by 西瓜 on 2011-4-22 at 16:29 ]
3楼2011-04-22 15:55:49
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-04-23 13:25:16
引用回帖:
Originally posted by dongfangzz at 2011-04-22 16:20:02:
如果实验组和对照组都做了5个标本,实验组中有4个标本的2-△△Ct是大于1的,但有一个标本的小于1。这样的结果又怎么判断?
能认为我的干预是阳性的吗?

实验组和对照组都取平均值,再比较吧。软件会给你算出标准偏差(SD)吧,5个重复标本的SD小于0.2就可以了。如果SD太大,可以舍弃1、2个偏差大的样品,一般3个重复样品就够了。
9楼2011-04-22 16:35:40
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普通回帖

elvias

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

dongfangzz(金币+2): 2011-04-22 16:37:20
从你的数据上看,实验组1 中你的目的基因mRNA的表达量是对照组的1.505倍,实验组2 中你的目的基因mRNA的表达量是对照组的0.246
2楼2011-04-22 15:30:48
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dongfangzz

银虫 (小有名气)

非常感谢elvias 和西瓜!
4楼2011-04-22 16:03:58
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dongfangzz

银虫 (小有名气)

西瓜传的ppt怎么打不开呀?
5楼2011-04-22 16:11:35
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
Originally posted by dongfangzz at 2011-04-22 16:11:35:
西瓜传的ppt怎么打不开呀?

囧了……我看看哈~不好意思!
6楼2011-04-22 16:15:12
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dongfangzz

银虫 (小有名气)

如果实验组和对照组都做了5个标本,实验组中有4个标本的2-△△Ct是大于1的,但有一个标本的小于1。这样的结果又怎么判断?
能认为我的干预是阳性的吗?
7楼2011-04-22 16:20:02
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
Originally posted by dongfangzz at 2011-04-22 16:11:35:
西瓜传的ppt怎么打不开呀?

我改成图片粘到帖子里啦
8楼2011-04-22 16:25:47
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dongfangzz

银虫 (小有名气)

谢谢!
10楼2011-04-22 16:35:56
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