24小时热门版块排行榜    

申请当版主 | 存档区 |应助排行|模拟EPI排行 小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 订阅

管理团队 (金币库 69390.4 充值 )

主管区长：
月只蓝小红豆
主管版主：
abinitio沙漠猎人

杰出贡献者

专家顾问：
pigrassoxox6085lsloneilbrucefanjerkwin
荣誉版主：
wuli8lei0736nono2009fegg7502ghcacjzzy870720zuuv2010御剑江湖yjcmwgkjiaoyixiongcenwanglaiben_ladengljw4010
荣誉成员：
余泽成
20941125/210首页上一页123124125126127128下一页
全部 专家会诊 MS LAMMPS/DL_POLY Gromacs/Amber/NAMD DS/Sybyl/Autodock Monte Carlo ME/Gulp Hyperchem CPMD/CP2K 资源 其他 版务
回帖排序 发表排序 刷新页面  |  交流  |  求助  |  资源精华区 作者 最后发表
[热点] 青椒八年已不青，大家都被折磨成啥样了？ 879310504 2026-01-26 刚刚
[LAMMPS/ ] windows下lammps中如何输出log.lammps文件，新手，求指导！ (评阅+1) (0/1442) 声梦奇缘001 2014-07-01 2014-07-01 14:41:26 by 声梦奇缘001
[LAMMPS/ ] 请问lammps中reax/c必须用respa积分器吗？ (评阅+1) (1/1111) truemantwo 2014-06-25 2014-07-01 10:28:35 by truemantwo
[专家会诊] [已完结]求助ZnO晶体模型的建立 (评阅+1) (6/1070) bingli_ted 2014-06-24 2014-07-01 10:27:25 by bingli_ted
[MS] [已完结]GCMC的粗粒化程序 (评阅+1) (0/309) missingwudi 2014-07-01 2014-07-01 10:23:38 by missingwudi
[Gromacs ] [已完结]Gromacs 做完拉伸分子动力学之后。计算能量 (评阅+1) (0/1183) jianchen7882 2014-07-01 2014-07-01 10:06:15 by jianchen7882
[其他] [已完结]新手求教；从RCSB数据库中获取的pdb文件总是两个对映体？ (4/1008) eattaniya 2014-06-28 2014-07-01 08:07:50 by polypro
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]势函数 bks (评阅+1) (3/1739) 向东1988 2013-12-10 2014-07-01 05:33:30 by sihao888
[MS] [已完结]计算报错求助 (评阅+1) (1/328) staventchoke 2014-06-24 2014-06-30 23:52:29 by 引弓落月
[其他] gromacs的数据处理 (评阅+1) (0/501) youngfi 2014-06-30 2014-06-30 21:37:54 by youngfi
[DS/Syby ] [已完结]新手关于autodock准备ligand分子时出现的问题 (评阅+1) (3/2328) 幻亦真 2014-06-27 2014-06-30 21:10:37 by pymol
[其他] 关于蛋白二级结构中的β-bridge (评阅+1) (4/1475) 转基因猴子 2014-06-27 2014-06-30 16:52:15 by lixiuhua
[MS] [已完结]用DMOL做计算时第三步出错是什么情况？？ (评阅+1) (1/296) 等待蝉唱 2014-06-28 2014-06-30 09:09:23 by 843172290
[DS/Syby ] [已完结]linux下的autodock在run autodock时不出现dlg文件 (8/2338) 邓芳 2013-06-03 2014-06-30 08:00:18 by 幻亦真
[其他] [已完结]请问发表论文，使用了AutoDock，需要引用吗？ (评阅+1) (1/798) M1ngq 2014-06-29 2014-06-29 14:24:08 by younghe
[MS] [已完结]用同样的软件做计算时同样是计算Co团簇为什么别人可以计算出来，我的却不可以 (评阅+1) (3/659) 等待蝉唱 2014-06-28 2014-06-29 10:04:37 by 牛犊小子
[MS] [已完结]怎么用Materials Studio 对cnt施加外力 (评阅+1) (0/362) 引弓落月 2014-06-29 2014-06-29 02:16:26 by 引弓落月
[Gromacs ] [已完结]amber跑动力学，晶体结构中的水能不能用限制力固定住 (8/1102) pujianbin 2014-06-28 2014-06-28 18:37:47 by beeMD
[DS/Syby ] [已完结][关贴]Run AutoGrid出现这样的错误，怎样解决？ (1/446) 戴世杰 2014-06-28 2014-06-28 14:04:51 by 戴世杰
[MS] [已完结]在materialstudio中建立管道 (评阅+1) (1/452) tim562944200 2014-06-18 2014-06-28 10:54:24 by 牛犊小子
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]sio2模型建立不正确    ( 1 2 ) (评阅+2) (13/3557) lvubaby 2013-11-09 2014-06-28 09:08:55 by sihao888
[MS] [已完结]请问坛里面的高手 MS软件对电脑配置的基本要求 普通笔记本电脑能行么..... (4/2545) zsw890820 2014-06-26 2014-06-28 07:28:32 by qingdong1990
[其他] [已完结]求能够批量建立多肽模型的软件？ (评阅+1) (0/968) voleyes 2014-06-27 2014-06-27 19:32:19 by voleyes
[其他] [已完结]用什么方法可以直接将RCSB PDB转换为charmm要求的PDB格式 (评阅+1) (1/1162) 416158716 2014-06-27 2014-06-27 18:53:12 by beeMD
[专家会诊] [已完结]请问计算小分子与蛋白的结合情况什么软件比较好？    ( 1 2 ) (评阅+1) (10/2453) zhangdi6802 2014-06-22 2014-06-27 17:45:37 by growlywolf
[Gromacs ] [已完结]Gromacs模拟温度耦合和压力耦合选择算法的问题，感谢！！！ (评阅+1) (4/2217) zhangmao511 2014-06-23 2014-06-27 16:41:12 by beeMD
[专家会诊] [已完结]请问关于同源建模蛋白中温度因子B-factor的提取 (评阅+1) (0/1594) 转基因猴子 2014-06-27 2014-06-27 16:22:53 by 转基因猴子
[Hyperch ] [已完结][关贴]请问hyperchem如何对一个分子库进行分子叠合？ (评阅+1) (0/540) whqllj 2014-06-27 2014-06-27 16:03:17 by whqllj
[Gromacs ] [已完结]gromacs蛋白计算结束后老是跑出盒子    ( 1 2 ) (评阅+1) (19/4443) 转基因猴子 2014-04-01 2014-06-27 12:51:42 by huyingdamon
[Gromacs ] [已完结]如何将膜蛋白的中心轴选转至Z轴方向 (评阅+1) (0/520) benniu2004 2014-06-27 2014-06-27 11:54:56 by benniu2004
[LAMMPS/ ] [已完结]Lammps安装时，其中的reax和meam包的安装问题 (评阅+1) (2/3481) 张禹萌 2014-04-09 2014-06-27 07:27:12 by starlink
[其他] 固-气分子间相互作用    ( 1 2 3 ) (评阅+1) (104/2197) xj200920075 2014-06-26 2014-06-26 19:35:35 by dxmpaper1
[LAMMPS/ ] [已完结]什么软件可以使用Tight-Binding Second Moment Approximation (TBSMA) potentials (评阅+1) (0/434) dyc_2008 2014-06-26 2014-06-26 19:22:47 by dyc_2008
[MS] [已完结]【解决方案分享贴】MS怎样从如图液态超晶胞中切出一个球体部分 (评阅+3) (3/1751) Johnnase 2014-06-26 2014-06-26 19:12:45 by 月只蓝
[MS] [已完结]50金币求助LiFePO4晶体的CIF格式的晶体结构图 (1/840) liuyuanyuan 2014-06-25 2014-06-26 15:08:08 by 月只蓝
[其他] 【求助】平衡问题 (2/334) amynihao 2010-11-08 2014-06-26 12:59:22 by wangyulinup
[资源] [已完结]求助分子可视化软件sirius1.2安装包，谢谢，官网上不去 (评阅+1) (0/391) z6242948 2014-06-26 2014-06-26 09:09:07 by z6242948
[MS] [已完结]求助：为什么我的Discover计算结果氢键键能为0？ (评阅+1) (2/987) 学员leB0zQ 2014-06-24 2014-06-26 07:44:23 by qingdong1990
[Monte C ] [已完结]一些关于模拟汽液相平衡的问题（towhee新手） (评阅+1) (4/1348) 992648352 2014-06-21 2014-06-25 21:10:54 by 豆豆sk8
[LAMMPS/ ] [已完结]LAMMPS中dpd模块的参数如何设置，求大家给予帮助 (评阅+1) (0/1054) tthappyy 2014-06-25 2014-06-25 16:15:43 by tthappyy
[Monte C ] [已完结]Towhee 计算出问题了，肯请高手指点下 (评阅+1) (5/807) 学员94tPwG 2014-05-16 2014-06-25 15:38:14 by q1036210267
[专家会诊] [smutao文集-自编教程]如何快速构建单链Polymer模型？ (评阅+6) (模拟EPI+1)(1/1065) smutao 2014-06-11 2014-06-25 15:18:18 by pigrass
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps tutorial (模拟EPI+1)(7/3090) zyx19840227 2011-05-25 2014-06-25 13:54:06 by liuzhu0706
[DS/Syby ] [已完结]3D-QSAR建模 (评阅+1) (0/1607) 13581286695 2014-06-25 2014-06-25 13:27:37 by 13581286695
[其他] [已完结]后处理显示内部原子排列形态 (评阅+1) (0/253) 骞耕 2014-06-25 2014-06-25 10:55:21 by 骞耕
[其他] [已完结]薛定谔软件建立药效团 (评阅+1) (0/1645) chenlixiaoli 2014-06-25 2014-06-25 09:53:08 by chenlixiaoli
[LAMMPS/ ] [已完结]vmd做pdb格式文件的动画求助    ( 1 2 ) (12/3272) zhang_jaj 2012-09-16 2014-06-25 07:29:55 by magicmonk
[MS] [已完结]高分子模拟软件探讨 (评阅+1) (9/2349) Andsharia 2014-06-22 2014-06-24 23:46:37 by beeMD
[其他] [已完结][关贴]紧急求助：谁会minimal topological difference方法做QSAR (评阅+1) (0/214) whqllj 2014-06-24 2014-06-24 21:05:43 by whqllj
[Gromacs ] [已完结]用amber做DNA分子模拟 (评阅+1) (0/2051) dxl20132009 2014-06-24 2014-06-24 17:47:06 by dxl20132009
[MS] [已完结]有谁能教下怎么建方晶石（110）面？求详细的步骤？还有切割的部分怎么做的？ (评阅+1) (2/675) 花开物语2013 2014-06-06 2014-06-24 15:21:37 by 花开物语2013
[Monte C ] [已完结]使用towhee进行GEMC模拟相平衡的MC运动定义问题..    ( 1 2 ) (15/3038) hyff 2011-05-05 2014-06-24 13:59:05 by 992648352
[MS] [已完结][关贴]Gromacs计算-----prodrg里面哪一个是我需要的top文件？ (评阅+1) (0/739) Andsharia 2014-06-24 2014-06-24 11:11:52 by 赵红霞
[DS/Syby ] liunx安装AutoDock (5/2039) x-cool 2012-05-19 2014-06-24 10:37:07 by linyingjia
[Gromacs ] [已完结]amber中NAB这个模块怎么使用 (评阅+1) (0/575) dxl20132009 2014-06-24 2014-06-24 09:39:49 by dxl20132009
[MS] MS模拟结束，复制问题，求教！    ( 1 2 ) (评阅+1) (17/1513) 憨憨米 2014-06-02 2014-06-24 09:26:54 by 憨憨米
[Gromacs ] [已完结]小分子pdb格式用prodrg转化为top和gro格式求助 (评阅+1) (4/2075) s6120610021 2014-01-04 2014-06-24 08:19:34 by 赵红霞
[专家会诊] [已完结]请问扩散系数与浓度的关系 (评阅+1) (1/2600) gzy_103 2014-06-23 2014-06-23 21:54:10 by gzy_103
[MS] [已完结]ms能不能建立硝酸银体系？ (评阅+1) (5/994) wangyisheng 2014-06-16 2014-06-23 21:45:36 by wangyisheng
[DS/Syby ] [已完结]使用UNIX进行AUTODOCK的对接，不知道有谁做过吗？ (评阅+1) (1/493) 科妍 2014-06-23 2014-06-23 20:58:23 by pymol
[其他] [已完结]求助化合物优势构型模拟的软件 (评阅+1) (0/299) abcdelm 2014-06-23 2014-06-23 19:40:54 by abcdelm
[专家会诊] [已完结]急求α、β和γ-环糊精的晶体结构数据 (3/1564) xjd1028 2012-06-10 2014-06-23 18:08:10 by huyingdamon
[LAMMPS/ ] [已完结]应下载lammps哪个版本 (评阅+1) (3/1574) lglhit 2014-06-19 2014-06-23 15:25:38 by starlink
[Monte C ] [已完结]请教DSMC方法一般设定多少个颗粒？时间步长怎么取？依据分别是什么 (评阅+1) (0/853) caicai714 2014-06-23 2014-06-23 13:24:29 by caicai714
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]lammps安装时mpich2的问题 (评阅+1) (2/1356) msy123 2013-11-30 2014-06-23 12:28:39 by starlink
[专家会诊] 求教什么是Ising scaling equation ?原理是什么？解决什么问题的？谢谢 (评阅+1) (1/325) 飞天小红猪 2014-06-23 2014-06-23 11:47:32 by lsloneil
[LAMMPS/ ] [已完结]怎么样设置非键相互作用系数？ (评阅+1) (0/963) issp-hao 2014-06-23 2014-06-23 11:12:35 by issp-hao
[其他] [已完结]求助！帮忙用Materials Studio模拟一下分子大小，谢谢了！ (评阅+1) (0/537) 共引离樽 2014-06-23 2014-06-23 11:06:30 by 共引离樽
[MS] [已完结]MS仿真动态模拟 (评阅+1) (8/2358) zhliang555 2014-06-10 2014-06-23 09:19:49 by zhliang555
[LAMMPS/ ] [已完结]拟合出Mo-W之间的morse势函数参数后如何用其验证Mo-W合金性质 (评阅+1) (1/1182) ytudou 2014-04-01 2014-06-23 06:47:44 by jyp356
[专家会诊] 转录因子模拟能发多少分的文章？ (评阅+1) (0/378) 穿孔大线虫 2014-06-23 2014-06-23 00:44:01 by 穿孔大线虫
[Gromacs ] [已完结]amber怎么处理模拟前的DNA    ( 1 2 ) (评阅+1) (10/2424) dxl20132009 2014-06-18 2014-06-22 23:38:21 by dxl20132009
[Gromacs ] [已完结]Gromacs关于能量最小化的问题！！！！！！！！ (评阅+1) (2/1464) zhangmao511 2014-06-13 2014-06-22 23:04:07 by zhangmao511
[MS] MS跑动力学的时候任务提交到服务器之后能关闭电脑吗？ (评阅+1) (4/1711) 小虫_sang 2014-06-21 2014-06-22 14:32:08 by 赵红霞
[其他] [已完结]关于VMD安装问题。。。。。。。。。 (6/2643) liuqiang2270 2012-12-18 2014-06-21 19:37:57 by happyzyf
[Gromacs ] [已完结]蛋白质中存在非标准残基的话如何在Gromacs中生成力场 (评阅+1) (2/1621) little_lion 2014-06-18 2014-06-21 19:36:01 by zhangmao511
[Monte C ] [已完结][关贴]运行MuSiC时段错误 (评阅+1) (0/426) jie0729 2014-06-21 2014-06-21 16:22:14 by jie0729
[专家会诊] [已完结]ubuntu12.10下chimera的安装 (评阅+1) (0/991) jianchen7882 2014-06-21 2014-06-21 15:57:46 by jianchen7882
[MS] [已完结]分子动力学模拟力场    ( 1 2 ) (13/4277) 点点滴滴2 2013-05-13 2014-06-21 14:19:11 by 小虫_sang
[其他] [已完结]请问高手，附件的图片是用什么软件画的？哪个软件比较好用？ (评阅+2) (1/297) yuansu 2014-06-21 2014-06-21 11:01:14 by jiazhuamh
[Gromacs ] 【求助】demo运行不了？    ( 1 2 ) (12/1676) ansrang 2010-05-03 2014-06-21 09:16:24 by 赵红霞
[Gromacs ] [已完结]请教关于gromacs计算单个氨基酸残基与配体相互作用能的问题 (评阅+1) (5/2221) 870277182 2014-05-23 2014-06-20 22:41:01 by zlf9452006
[MS] [已完结]截断半径设置问题 (评阅+1) (7/3526) 小虫_sang 2014-06-18 2014-06-20 18:55:31 by 小虫_sang
[其他] 精华I:  【原创】关于MATLAB 描述分子布朗运动等行为的过程    ( 1 2 ) (59/9228) 雪狼乖乖 2010-05-03 2014-06-20 11:35:26 by 雪狼乖乖
[MS] [已完结]MSD求助 (评阅+1) (5/663) 虫虫小小小 2014-06-15 2014-06-20 10:33:52 by 虫虫小小小
[MS] [已完结]MS导出数据关于RDF的分析 (评阅+1) (3/967) sbingyi 2014-04-10 2014-06-19 19:58:29 by sbingyi
[DS/Syby ] [已完结]DS2.5安装出现这个界面是什么原因？怎么解决？ (评阅+1) (0/231) 戴世杰 2014-06-19 2014-06-19 19:16:47 by 戴世杰
[专家会诊] [已完结]在算模拟盒子的压力的时候，在算非理想气体项时需要对粒子使用镜像作用吗 (评阅+1) (6/988) chenjingzhi 2014-06-19 2014-06-19 17:00:59 by iamthinking
[其他] [已完结]Origin作FFT问题 (评阅+1) (0/1353) _蝶飞 2014-06-19 2014-06-19 15:42:28 by _蝶飞
[MS] [已完结]MS建模中遇到的问题 (评阅+1) (1/461) showtime0703 2014-06-16 2014-06-19 15:28:11 by showtime0703
[其他] [已完结]安装intel编译器，设置环境变量出现warning：‘gcc’ was not found (评阅+1) (1/4146) yichen0405 2014-06-17 2014-06-19 14:46:10 by iamthinking
[专家会诊] [已完结]请问分子模拟能否计算重油或大分子烃类的生成热。 (评阅+1) (0/293) matwav 2014-06-19 2014-06-19 10:10:16 by matwav
[DS/Syby ] [已完结]怎样使用DS或者是autodock在模拟好的蛋白中加入铜离子 (评阅+1) (3/908) guojing113 2014-06-11 2014-06-19 09:16:24 by blue_cat
[CPMD/CP ] [已完结]求cpmd程序和contrib (评阅+1) (0/692) linusjenny 2014-06-19 2014-06-19 07:48:18 by linusjenny
[其他] [已完结]Mdynamix 需要计算氢键对体系的影响 (评阅+1) (0/249) 渭水飞熊 2014-06-18 2014-06-18 18:17:01 by 渭水飞熊
[其他] [已完结]这样有立体感的图文摘要如何画。用什么软件能做到。。 (评阅+1) (2/1431) 冰王子1 2014-06-18 2014-06-18 17:17:49 by 冰王子1
[CPMD/CP ] [已完结]CP2K中combine_colvar怎么设置？ (评阅+1) (1/1536) gnli 2014-06-17 2014-06-18 16:42:01 by safina.din
[其他] [已完结]分子的动力学直径怎么算？ (评阅+1) (0/760) hugepeking 2014-06-18 2014-06-18 15:55:41 by hugepeking
[Gromacs ] [已完结]请问我这个体系是否需要进行自由能的计算？？？ (评阅+1) (4/1219) zhangmao511 2014-06-16 2014-06-18 14:53:19 by zhangmao511
[Gromacs ] CHARMM参数化的最新问题，请教Bay (17/1539) zmz148002989 2012-05-24 2014-06-18 13:20:14 by 29050801
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]关于lammps计算应力——应变的几个问题 (评阅+1) (2/3991) honghaier90 2013-11-13 2014-06-18 12:26:08 by lwf314159
20941125/210首页上一页123124125126127128下一页
相关版块跳转
查看