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Gromacs/Amber/NAMD
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zju2000
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Gromacs
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[已完结]
请教关于gromacs计算单个氨基酸残基与配体相互作用能的问题
(评阅+1)
(5/2484)
870277182
2014-05-23
2014-06-20 22:41:01
by
zlf9452006
[
MS
]
[已完结]
截断半径设置问题
(评阅+1)
(7/4014)
小虫_sang
2014-06-18
2014-06-20 18:55:31
by
小虫_sang
[
其他
]
精华
I
:
【原创】关于MATLAB 描述分子布朗运动等行为的过程
(
1
2
)
(59/12153)
雪狼乖乖
2010-05-03
2014-06-20 11:35:26
by
雪狼乖乖
[
MS
]
[已完结]
MSD求助
(评阅+1)
(5/772)
虫虫小小小
2014-06-15
2014-06-20 10:33:52
by
虫虫小小小
[
MS
]
[已完结]
MS导出数据关于RDF的分析
(评阅+1)
(3/1085)
sbingyi
2014-04-10
2014-06-19 19:58:29
by
sbingyi
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS2.5安装出现这个界面是什么原因?怎么解决?
(评阅+1)
(0/287)
戴世杰
2014-06-19
2014-06-19 19:16:47
by
戴世杰
[
专家会诊
]
[已完结]
在算模拟盒子的压力的时候,在算非理想气体项时需要对粒子使用镜像作用吗
(评阅+1)
(6/1182)
chenjingzhi
2014-06-19
2014-06-19 17:00:59
by
iamthinking
[
其他
]
[已完结]
Origin作FFT问题
(评阅+1)
(0/1387)
_蝶飞
2014-06-19
2014-06-19 15:42:28
by
_蝶飞
[
MS
]
[已完结]
MS建模中遇到的问题
(评阅+1)
(1/535)
showtime0703
2014-06-16
2014-06-19 15:28:11
by
showtime0703
[
其他
]
[已完结]
安装intel编译器,设置环境变量出现warning:‘gcc’ was not found
(评阅+1)
(1/4277)
yichen0405
2014-06-17
2014-06-19 14:46:10
by
iamthinking
[
专家会诊
]
[已完结]
请问分子模拟能否计算重油或大分子烃类的生成热。
(评阅+1)
(0/331)
matwav
2014-06-19
2014-06-19 10:10:16
by
matwav
[
DS/Syby
]
[已完结]
怎样使用DS或者是autodock在模拟好的蛋白中加入铜离子
(评阅+1)
(3/1066)
guojing113
2014-06-11
2014-06-19 09:16:24
by
blue_cat
[
CPMD/CP
]
[已完结]
求cpmd程序和contrib
(评阅+1)
(0/744)
linusjenny
2014-06-19
2014-06-19 07:48:18
by
linusjenny
[
其他
]
[已完结]
Mdynamix 需要计算氢键对体系的影响
(评阅+1)
(0/291)
渭水飞熊
2014-06-18
2014-06-18 18:17:01
by
渭水飞熊
[
其他
]
[已完结]
这样有立体感的图文摘要如何画。用什么软件能做到。。
(评阅+1)
(2/1526)
冰王子1
2014-06-18
2014-06-18 17:17:49
by
冰王子1
[
CPMD/CP
]
[已完结]
CP2K中combine_colvar怎么设置?
(评阅+1)
(1/1628)
gnli
2014-06-17
2014-06-18 16:42:01
by
safina.din
[
其他
]
[已完结]
分子的动力学直径怎么算?
(评阅+1)
(0/812)
hugepeking
2014-06-18
2014-06-18 15:55:41
by
hugepeking
[
Gromacs
]
[已完结]
请问我这个体系是否需要进行自由能的计算???
(评阅+1)
(4/1493)
zhangmao511
2014-06-16
2014-06-18 14:53:19
by
zhangmao511
[
Gromacs
]
CHARMM参数化的最新问题,请教Bay
(17/2259)
zmz148002989
2012-05-24
2014-06-18 13:20:14
by
29050801
[
LAMMPS/
]
[已完结]
[关贴]
关于lammps计算应力——应变的几个问题
(评阅+1)
(2/4169)
honghaier90
2013-11-13
2014-06-18 12:26:08
by
lwf314159
[
MS
]
[已完结]
关于MS做分子动力学的问题
(8/3438)
Zr891002
2013-04-01
2014-06-18 12:12:54
by
aa2349439
[
Monte C
]
[已完结]
求助MuSic小问题
(8/1827)
xinghe99
2012-11-13
2014-06-18 11:53:22
by
jie0729
[
Gromacs
]
用gromacs跑膜动力学
(评阅+1)
(3/1803)
zhuimeng08
2014-06-17
2014-06-18 11:20:29
by
zhuimeng08
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps 拉伸应力应变曲线
(4/5829)
zhangjiongl
2013-03-21
2014-06-18 08:00:47
by
lwf314159
[
LAMMPS/
]
[已完结]
活化能
(评阅+2)
(1/901)
王慧1021
2014-06-17
2014-06-17 22:11:38
by
王慧1021
[
LAMMPS/
]
Gui提取DL_POLY4.0跑完动力学生成的STATIS势能参数
(评阅+1)
(0/318)
wangyulinup
2014-06-17
2014-06-17 19:59:00
by
wangyulinup
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS构建药效团decoy数据库构建
(8/2158)
xiaodaolai
2013-10-15
2014-06-17 15:26:05
by
xiaodaolai
[
LAMMPS/
]
[已完结]
DL_POLY 如何添加新的势函数
(6/1398)
alanxy3000
2013-06-19
2014-06-17 06:17:36
by
云水魅影
[
MS
]
[已完结]
构象问题(MOE)
(评阅+1)
(1/1351)
mac1257
2014-06-10
2014-06-16 22:47:46
by
爱笑的岛民
[
MS
]
[已完结]
聚合物晶胞构建
(评阅+1)
(8/2346)
staventchoke
2014-04-30
2014-06-16 20:42:30
by
peerlesszjh
[
MS
]
[已完结]
以Cu超胞 6*6*3 Fe超胞7*7*3为基础建立Cu-Fe layer 用discover minimizer失败 求原因
(评阅+1)
(2/541)
Point_Chen
2014-05-28
2014-06-16 19:44:52
by
月只蓝
[
资源
]
[已完结]
[关贴]
谁有这本书,网分享!
(0/417)
992648352
2014-06-16
2014-06-16 17:12:57
by
992648352
[
DS/Syby
]
[已完结]
如何将像TXT那样的蛋白质结构信息变成可识别的PDB结构,求大神指点。。。拜托拜托
(评阅+1)
(7/1969)
margaretli
2014-06-08
2014-06-15 20:59:37
by
margaretli
[
Gromacs
]
[已完结]
从Amber生成的轨迹中抽取出蛋白和小分子的结构
(评阅+1)
(1/2344)
lmyiop
2014-06-14
2014-06-15 12:40:05
by
jiazhuamh
[
资源
]
20120323-化合物靶标识别(创腾科技)
(32/1842)
chenxin1888
2012-04-06
2014-06-15 09:02:37
by
wang369
[
其他
]
亮点不够的催化相关分子模拟工作投稿期刊
(评阅+1)
(0/404)
lggm208
2014-06-14
2014-06-14 10:18:51
by
lggm208
[
MS
]
[已完结]
Dmol3模块计算Pt金属能量分析
(评阅+1)
(0/729)
白发魔女
2014-06-13
2014-06-13 22:34:39
by
白发魔女
[
其他
]
镧系金属配合物与检测物结合的后续表征
(评阅+1)
(0/266)
lliuhuawei
2014-06-13
2014-06-13 15:00:03
by
lliuhuawei
[
MS
]
[已完结]
ms计算可否定时保存分子构型
(评阅+1)
(5/728)
wangyisheng
2014-06-12
2014-06-13 10:23:32
by
wangyisheng
[
Monte C
]
[已完结]
[关贴]
MUSIC软件谁能发我一份,GCMC模拟新手
(评阅+1)
(0/1067)
wangfly2009
2014-06-13
2014-06-13 09:06:04
by
wangfly2009
[
LAMMPS/
]
[已完结]
模拟单轴拉伸和玻璃化转变温度,参数该如何选择?
(评阅+1)
(3/1947)
fyc802
2014-06-12
2014-06-12 23:06:29
by
pigrass
[
CPMD/CP
]
[已完结]
cpmd总是警告:CENTER OF MASS VELOCITY NOT ZERO
(评阅+1)
(0/510)
nature617
2014-06-12
2014-06-12 22:29:47
by
nature617
[
专家会诊
]
[已完结]
怎么看蛋白内残基间氢键,盐桥,二硫键等作用力
(评阅+1)
(1/4207)
zhengwei0407
2014-06-12
2014-06-12 21:21:36
by
smutao
[
Gromacs
]
[已完结]
设置电荷
(评阅+1)
(1/321)
wjf12
2014-06-12
2014-06-12 21:11:14
by
smutao
[
CPMD/CP
]
[已完结]
NPT系综下如何设置Langevin thermostat
(3/1804)
ustbmars
2012-10-20
2014-06-12 19:36:31
by
hufeng
[
MS
]
[已完结]
溶液离子与聚合物相互作用的软件,求推荐
(
1
2
)
(评阅+1)
(10/1467)
Andsharia
2014-06-05
2014-06-12 18:41:47
by
qianxiong
[
Monte C
]
[已完结]
[关贴]
文献求助,真的很需要,各位帮帮忙
(评阅+1)
(1/346)
bobobo205
2014-06-12
2014-06-12 16:14:12
by
苦逼牛逼
[
DS/Syby
]
[已完结]
做autodock时,受体中金属离子的处理
(7/2191)
fangmi814
2012-12-21
2014-06-12 14:11:31
by
pymol
[
Hyperch
]
[已完结]
哪位大神能帮忙把这个分子的两个构型模拟出空间结构!!
(评阅+1)
(3/1583)
xiaomaque000
2014-06-11
2014-06-12 13:44:29
by
pigrass
[
CPMD/CP
]
[已完结]
CPMD和MD
(评阅+1)
(1/1863)
向日葵2012
2014-06-11
2014-06-12 11:27:05
by
lsloneil
[
MS
]
[已完结]
分子模拟初学者,求一个gamma-AL2O3模型
(评阅+1)
(7/2142)
zhlm1227cs
2014-06-11
2014-06-12 11:00:08
by
zhlm1227cs
[
MS
]
Physics of Covered Solid Surfaces--分子模拟可以使用的参考
(10/742)
anmin0127
2013-07-23
2014-06-12 10:51:34
by
yj90325
[
MS
]
[已完结]
IECR参考文献中专利的格式要求是什么?
(评阅+1)
(0/943)
小小明12345
2014-06-12
2014-06-12 10:13:17
by
小小明12345
[
MS
]
[已完结]
linux安装到Running installation ...不动了,是怎么回事啊?
(评阅+1)
(2/428)
阡陌蔓
2014-05-30
2014-06-12 08:33:32
by
阡陌蔓
[
MS
]
[已完结]
为什么我的MS软件每周都得重新安装?
(4/1102)
hejucen
2014-06-04
2014-06-11 21:28:22
by
badercao
[
LAMMPS/
]
[已完结]
请问大牛,怎么分析出错信息
(评阅+1)
(1/515)
313838515
2014-06-09
2014-06-11 20:59:16
by
starlink
[
DS/Syby
]
[已完结]
薛定谔 glide sp dock 使用的一些疑问
(评阅+1)
(2/1256)
tbw258
2014-06-02
2014-06-11 20:53:31
by
tbw258
[
其他
]
精华
II
:
【原创】分子模拟实例与挑战专题之二加速能量与力的计算
(28/6660)
yahoohoo
2010-09-15
2014-06-11 18:53:52
by
chenjingzhi
[
其他
]
[已完结]
如何将pisco导入Pymol中啊?求助
(评阅+1)
(0/353)
merlinczar
2014-06-11
2014-06-11 16:48:09
by
merlinczar
[
MS
]
这个图是用什么软件做的啊,求助
(评阅+1)
(2/531)
jijianjndx
2014-06-11
2014-06-11 16:17:11
by
jiaoyixiong
[
DS/Syby
]
ucsf dock6 在ubuntu12的安装过程
(2/1779)
lfcmike
2013-03-03
2014-06-11 15:46:47
by
linyuxin
[
DS/Syby
]
[已完结]
autodock怎么处理配体里的金属原子
(评阅+1)
(2/1833)
_蝶飞
2014-06-10
2014-06-11 13:01:39
by
_蝶飞
[
DS/Syby
]
Pymol上Autodock插件,在Generate receptor时出错。系统Mac 10.9
(评阅+1)
(1/1112)
hijacklzs
2014-05-10
2014-06-11 11:15:13
by
0532shaka
[
专家会诊
]
[已完结]
[关贴]
求助autodock plugin for pymol win版的问题
(评阅+1)
(0/1042)
0532shaka
2014-06-11
2014-06-11 11:01:20
by
0532shaka
[
Gromacs
]
[已完结]
g_dipoles问题
(1/614)
lihaohoney
2011-10-16
2014-06-11 11:01:14
by
_蝶飞
[
Gromacs
]
[已完结]
分子动力学模拟软件如何选择
(评阅+1)
(4/2156)
郭宇琦
2014-06-11
2014-06-11 11:00:51
by
郭宇琦
[
Gromacs
]
[已完结]
请问g_dipoles的问题
(2/610)
lihaohoney
2011-11-19
2014-06-11 10:16:45
by
_蝶飞
[
MS
]
大家来交流下,你们在用MS模拟的时候分子设置的颜色^_^
(评阅+1)
(4/1085)
憨憨米
2014-06-08
2014-06-11 08:50:11
by
憨憨米
[
ME/Gulp
]
[已完结]
如何在GULP中加入coulomb interaction?
(评阅+1)
(1/679)
kimi838
2014-06-10
2014-06-11 02:47:58
by
oxox6085
[
Monte C
]
[已完结]
gcmc运行的时候出错?
(评阅+1)
(0/483)
羊羊咩咩
2014-06-10
2014-06-10 22:27:47
by
羊羊咩咩
[
其他
]
[已完结]
如何去除pdb文件里面的对称蛋白结构
(评阅+1)
(2/1606)
biogefart
2014-06-10
2014-06-10 22:27:01
by
pymol
[
MS
]
[已完结]
求助吸附能计算问题
(评阅+1)
(1/1412)
jyhit
2014-06-08
2014-06-10 17:48:28
by
jyhit
[
DS/Syby
]
[已完结]
蛋白质稳定性分析中ddG是什么意思?
(评阅+1)
(0/1007)
天湖酒
2014-06-10
2014-06-10 16:19:56
by
天湖酒
[
MS
]
[已完结]
RMSF和RMSD有什么区别
(评阅+1)
(2/5237)
无敌炉石
2014-06-10
2014-06-10 15:53:23
by
无敌炉石
[
专家会诊
]
[已完结]
MS中compass力场算TiO2一直出错
(评阅+1)
(5/2271)
paladinlee
2013-10-29
2014-06-10 15:52:42
by
swugzlx
[
DS/Syby
]
[已完结]
下载琥珀酸脱氢酶的蛋白
(评阅+1)
(1/542)
dsj5216
2014-06-10
2014-06-10 12:57:03
by
lrf1980
[
MS
]
MS可以模拟升降温过程吗?
(评阅+1)
(4/1196)
ONGIONG
2014-06-08
2014-06-10 09:34:00
by
lkd-syl
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求一个函数的概念
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zhang_jaj
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2014-06-09 22:10:39
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zhang_jaj
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LAMMPS/
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[求助]精彩推荐:有关不同系综下的物理量计算方法是否一样的问题
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ysshj
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ysshj
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多个势函数
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yolanda1234
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DS运行后的文件保存路径怎么更改?
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@漂洋过海@
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CASTEP的高手看过来
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liuxiaodang
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江湖救急:在amber里跑md轨迹时,遇到很严重的问题,求大神来指教。
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lifeisall
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求助MuSiC实例
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jie0729
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如何用chem 3D 画出这种分子结构图
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k677p003
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求ZINC数据库的下载
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xiaoxuancao
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xiaoxuancao
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autodock安装使用问题
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linyuxin
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小分子中含有Pt原子,怎么进行对接
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_蝶飞
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金属表面水层怎么添加?
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blackeagle11
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拉伸分子动力学PMF分析
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jianchen7882
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关于amber中 explicit solvent和implicit solvent的解释
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2013-05-08
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xikunneo1989
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拉伸分子动力学步骤
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请问谁可以告诉我这种图如何做出来,重金感谢!!!!!!!!!!
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126406380
2014-06-08
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MS
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团簇的基态构型趋于平面说明什么呢
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等待蝉唱
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gromacs动力学结果分析
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逝水2939
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氮硼纳米管模拟
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po390
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求助AutoDock如何设置参数使已有PDB文件中Mg离子与配体可以形成氢键氢键?
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lnu101
2014-04-09
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动力学模拟中标准键长数据在立场里还是拓扑文件里读取
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29050801
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MS
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comsol的自带模型库有哪些模型
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ZYM1509209
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LAMMPS/
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lammps下载及安装教程
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linwh
2014-01-02
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vgjhvgj
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