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xiaodaolai

银虫 (小有名气)

[求助] DS构建药效团decoy数据库构建

本人现在在做药效团,希望构建出Decoy数据库加以验证,请问怎么构建Decoy数据库啊?
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如果时光倒流,我们又能抓的住什么
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iovvoi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
decoy数据库就是测试集  由活性分子和非活性分子组成
2楼2013-10-15 20:33:31
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xiaodaolai

银虫 (小有名气)

恩恩,这个我知道,我是想问选择好了活性分子后,如何用活性分子去找到非活性分子,从而构成Decoy数据库,我想问具体方法,谢谢!
如果时光倒流,我们又能抓的住什么
3楼2013-10-16 11:04:36
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xiaodaolai

银虫 (小有名气)

哪位大神帮帮忙啊,真的很急啊啊啊啊啊
如果时光倒流,我们又能抓的住什么
4楼2013-10-24 11:06:31
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xiaodaolai

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by iovvoi at 2013-10-15 20:33:31
decoy数据库就是测试集  由活性分子和非活性分子组成

大哥,能具体说说方法吗,万分感谢啊
如果时光倒流,我们又能抓的住什么
5楼2013-10-24 11:07:08
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hinry

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

有篇参考文献,讲解了怎么构建Decoy set :Virtual decoy sets for molecular docking benchmarks, J. Chem. Inf. Model. 51 (2011) 196-202. ;还有一个decoy 数据库,里面包含了大多已知靶点的decoy set,你可以google 一下!
6楼2013-10-27 09:45:42
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xiaodaolai

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hinry at 2013-10-27 09:45:42
有篇参考文献,讲解了怎么构建Decoy set :Virtual decoy sets for molecular docking benchmarks, J. Chem. Inf. Model. 51 (2011) 196-202. ;还有一个decoy 数据库,里面包含了大多已知靶点的decoy set,你可以g ...

好的,谢谢
如果时光倒流,我们又能抓的住什么
7楼2013-10-27 15:05:34
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ygyxyz89

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xiaodaolai at 2013-10-27 15:05:34
好的,谢谢...

能不能问一下,用decoy set 筛选所用的参数是什么?
8楼2014-06-17 11:06:27
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xiaodaolai

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by ygyxyz89 at 2014-06-17 11:06:27
能不能问一下,用decoy set 筛选所用的参数是什么?...

什么参数?默认的
如果时光倒流,我们又能抓的住什么
9楼2014-06-17 18:26:05
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