| 查看: 2678 | 回复: 11 | |||
[交流]
如何选decoy set，做虚拟筛选？
|
|||
|
我有一篇文章，审稿人的意见说，我建立的QSAR模型（CoMFA和CoMSIA）只用了测试集，为了验证我的模型的预测能力，应该用这个模型从商业数据库中选择新的分子，然后做实验来验证，或者"at least decoy set of compounds to measure the potential enrichment in a virtual screening process." 这个decoy集从哪里选啊？ 原来没有遇到这个问题啊，就用训练集建立模型，用测试集验证模型的预测能力，现在还要decoy集，怎么办呢？ 这个集合，自己构建吗？还是从别的网站下载小分子，然后再预测呢？ |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
Eviler16» 猜你喜欢
论文的挂名怎么评判贡献？基金申请中，排名第一的挂名文章
已经有3人回复
-
越来越担心硕士毕业后没有竞争力了
已经有13人回复
-
申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请
已经有3人回复
-
闲聊
已经有6人回复
-
申博求助
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 谁知道怎么在excel做平均数图表？
已经有3人回复
- 一款很不错的虚拟桌面，直接运行免安装！【原创】
已经有22人回复
- 做培养基优化，因素特别多，能否分开做两次PB筛选?
已经有10人回复
- 想做毕业论文却不知如何选题
已经有15人回复
- 除了利用同源性做PCR外，如何定向筛选一个基因？
已经有4人回复
- 有做四苯基卟啉合成和硝化的虫友们请进来帮忙，100金币先~~~有好的回答继续追加~
已经有13人回复
- 国家纳米科学中心诚招：联合培养硕士，博士研究生和做毕业设计的本科生
已经有6人回复
- 【求助】环糊精对有机小分子包合的空间模拟怎么做
已经有12人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
海南大学邱天宇老师团队招收博士生与招聘博士后
+5/660
-
坐标苏州，诚聘女友
+1/287
-
大连理工大学机械工程学院招收微纳及原子制造方向博士生
+1/197
-
溶质液晶释放必须用PBS吗？
+1/97
-
涂层低温高湿（雨淞覆冰）测试
+1/92
-
海南大学徐月山招收2027年第一批博士研究生1个
+1/87
-
南开大学环境科学与工程学院 环境与人体健康方向 招博士研究生、硕士研究生各1名
+1/69
-
哈尔滨工业大学招收博士研究生（欢迎环境、生物、市政、农业、化学等专业）长期有效
+1/40
-
北京理工大学深圳汽车研究院长期招收联培学生/实习生
+1/37
-
北京地区寻找高校课题组兼职博士后
+1/34
-
浙大许军课题组招聘
+1/19
-
上海交通大学-苏州国家实验室联合培养博士生招生（2027年春/秋季入学·申请考核制）
+1/12
-
【招聘】荷兰格罗宁根大学CSC公派博士生，材料/高分子/化学相关背景
+1/7
-
【2027博士招生】福州大学姚建年院士课题组招收博士研究生2名
+1/5
-
您身边的科研非标定制专家--赛思睿
+1/4
-
海南大学化学化工学院｜2027级博士招生｜生物质材料、光热蒸发、盐差能发电方向
+1/4
-
二审Required Reviews Complete了
+1/3
-
中性粒细胞分泌因子：从颗粒蛋白到细胞因子的功能谱系
+1/3
-
百万单元软组织模型一装配就爆内存：生物力学血流仿真遇上大模型本地部署工作站
+1/3
-
【招聘】荷兰格罗宁根大学CSC公派博士生，材料/高分子/化学相关背景
+1/1
3楼2011-11-09 09:11:06
★ ★ ★
bbslover(金币+1):谢谢参与
bbslover(金币+5): 2011-11-09 12:26:06
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-11-09 20:38:03
bbslover(金币+1):谢谢参与
bbslover(金币+5): 2011-11-09 12:26:06
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-11-09 20:38:03
|
做decoy可以选用DUD的库，有基于受体的也有基于配体的， http://dud.docking.org/ 个人觉得decoy这玩意鸡肋的很 |
4楼2011-11-09 09:16:12
5楼2011-11-09 09:47:16
6楼2011-11-09 12:28:23
7楼2011-11-11 10:49:42
8楼2011-11-12 09:51:39
9楼2011-12-02 15:37:17
10楼2011-12-03 22:38:03
★
bbslover(金币+1): 谢谢参与
bbslover(金币+1): 谢谢参与
|
本帖内容被屏蔽 |
11楼2012-04-25 12:04:49
12楼2016-02-24 18:31:43
简单回复
clszdy2楼
2011-11-08 23:03
回复
bbslover(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币-1): 厚道 2011-11-13 20:14:41
御剑江湖(金币-1): 厚道 2011-11-13 20:14:41
