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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【求助】环糊精对有机小分子包合的空间模拟怎么做
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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loveyy511

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】环糊精对有机小分子包合的空间模拟怎么做 已有6人参与

想做β-环糊精对药物的空间构型模拟，可是在我看来计算机化学模拟好像很难，看了几篇有关空间结构模拟的文献都没怎么看懂，所以想在此请教一下师兄师姐们，这究竟该怎么做啊，用什么软件可以做，怎么做，这个软件最好很容易得到，谢谢啦，各位师兄师姐请以环糊精包合苯的例子指导一下我，非常感谢！
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1楼 2010-03-12 11:24:06
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fegg7502

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无

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mingdong(金币+2):感谢交流! 2010-03-13 22:59
采用团簇模型，能考虑dispersion的
或者MP2也可以
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心诚意正，方可始终；身无苦灭，永登光明。
2楼2010-03-13 22:10:21
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fangxingbaixue

木虫 (知名作家)

gxgm111
好深奥啊~~~
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love my guamei forever
3楼2010-03-13 23:37:43
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loveyy511

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by fegg7502 at 2010-03-13 22:10:21:
采用团簇模型，能考虑dispersion的
或者MP2也可以

请问师兄可以说的具体一些么？有没有易得的软件来做呢？谢谢
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4楼2010-03-15 18:14:35
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fegg7502

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mingdong(金币+1):感谢交流! 2010-03-15 22:58
高斯就可以啦，选在MP2的方法
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5楼2010-03-15 18:17:15
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loveyy511

银虫 (正式写手)
★
dongdong3881(金币+1):多谢回帖 2010-03-16 21:23
引用回帖:
Originally posted by fegg7502 at 2010-03-15 18:17:15:
高斯就可以啦，选在MP2的方法

谢谢师兄，看来我要好好学习一下啦
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6楼2010-03-16 18:06:19
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
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引用回帖:
Originally posted by fegg7502 at 2010-03-13 22:10:21:
采用团簇模型，能考虑dispersion的
或者MP2也可以

那么环糊精的pdb图怎么导入呢，还有客体分子怎么和主体分子放在一块啊
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7楼2010-09-10 15:44:25
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fegg7502

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luoqiquan(金币+1):thank you 2010-09-10 18:42:04
引用回帖:
Originally posted by 天下枫叶 at 2010-09-10 15:44:25:

那么环糊精的pdb图怎么导入呢，还有客体分子怎么和主体分子放在一块啊

很多软件可以做这个，高斯，discover，MS，等
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8楼2010-09-10 15:55:32
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suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫
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引用回帖:
Originally posted by fegg7502 at 2010-03-13 22:10:21:
采用团簇模型，能考虑dispersion的
或者MP2也可以

如果MP2可以做的话，那简直是个奇迹。
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做中国人的化学！！！！
9楼2010-09-12 11:40:59
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ww1987

铁杆木虫 (小有名气)
★
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去看看文献吧 有人做过  估计现在还没有软件能算MP2模拟环糊精吧
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10楼2010-09-12 23:27:26
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