应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS构建药效团decoy数据库构建
91/1返回列表
查看: 2199  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xiaodaolai

银虫 (小有名气)

[求助] DS构建药效团decoy数据库构建

本人现在在做药效团，希望构建出Decoy数据库加以验证，请问怎么构建Decoy数据库啊？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
如果时光倒流，我们又能抓的住什么
1楼 2013-10-15 11:17:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

iovvoi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
decoy数据库就是测试集  由活性分子和非活性分子组成
赞一下 回复此楼
2楼2013-10-15 20:33:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaodaolai

银虫 (小有名气)
恩恩，这个我知道，我是想问选择好了活性分子后，如何用活性分子去找到非活性分子，从而构成Decoy数据库，我想问具体方法，谢谢！
赞一下 回复此楼
如果时光倒流，我们又能抓的住什么
3楼2013-10-16 11:04:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaodaolai

银虫 (小有名气)
哪位大神帮帮忙啊，真的很急啊啊啊啊啊
赞一下 回复此楼
如果时光倒流，我们又能抓的住什么
4楼2013-10-24 11:06:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaodaolai

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by iovvoi at 2013-10-15 20:33:31
decoy数据库就是测试集  由活性分子和非活性分子组成

大哥，能具体说说方法吗，万分感谢啊
赞一下 回复此楼
如果时光倒流，我们又能抓的住什么
5楼2013-10-24 11:07:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hinry

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

有篇参考文献，讲解了怎么构建Decoy set ：Virtual decoy sets for molecular docking benchmarks, J. Chem. Inf. Model. 51 (2011) 196-202. ；还有一个decoy 数据库，里面包含了大多已知靶点的decoy set，你可以google 一下！
赞一下 回复此楼
6楼2013-10-27 09:45:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaodaolai

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hinry at 2013-10-27 09:45:42
有篇参考文献，讲解了怎么构建Decoy set ：Virtual decoy sets for molecular docking benchmarks, J. Chem. Inf. Model. 51 (2011) 196-202. ；还有一个decoy 数据库，里面包含了大多已知靶点的decoy set，你可以g ...

好的，谢谢
回复此楼
如果时光倒流，我们又能抓的住什么
7楼2013-10-27 15:05:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ygyxyz89

新虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by xiaodaolai at 2013-10-27 15:05:34
好的，谢谢...

能不能问一下，用decoy set 筛选所用的参数是什么？
赞一下 回复此楼
8楼2014-06-17 11:06:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaodaolai

银虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by ygyxyz89 at 2014-06-17 11:06:27
能不能问一下，用decoy set 筛选所用的参数是什么？...

什么参数？默认的
赞一下 回复此楼
如果时光倒流，我们又能抓的住什么
9楼2014-06-17 18:26:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiaodaolai 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +14 Kittylucky 2026-08-27 15/750 2026-09-02 19:35 by liumei0601
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了，新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西，结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了，像什么等级？ 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭