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Zr891002

金虫 (小有名气)

[求助] 关于MS做分子动力学的问题

为什么我试着用discover或者forcite做分子动力学模拟,不管2W或者3W步还是20W 30W步,感觉那些分子基本在原地动啊,而且还会跑出盒子,谁知道这是为什么啊?怎么解决啊,我看别人做的 分子能从盒子的一边跑到另外一边,而我的模型 基本就左右晃晃!~~

求解啊!~~大神们
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加油,一定能成功
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Zr891002

金虫 (小有名气)

求救啊!~~~~大神们!~~~~~~
加油,一定能成功
2楼2013-04-01 19:55:24
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stalart

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-02 08:29:41
你的温度设多少?
3楼2013-04-01 21:34:41
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Zr891002

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stalart at 2013-04-01 21:34:41
你的温度设多少?

293K
加油,一定能成功
4楼2013-04-01 21:43:27
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
检查一下力场,力场使用不恰当的话,可能就会这样,还有就是截断半径
壁立万仞,无欲则刚
5楼2013-04-02 08:30:31
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zx2456

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先你想做的什么体系啊,还有就是你输入的初始结构是什么样的,如果你输入的结构本来就接近最低能量状态,那么就会出现你这种状况啊。多数还是跟你的初始结构和势函数的选取有关。
6楼2013-04-02 09:25:13
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水中波纹

金虫 (正式写手)

关注。。。
你把注意力集中在什么想法和感受上,你就把它们吸引到你的生活中,不管它是不是你所期待的。
7楼2013-04-03 15:13:39
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yangwenbin99

铜虫 (小有名气)

强烈关注
8楼2013-04-03 21:21:23
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aa2349439

新虫 (小有名气)

这个,我也是这么个问题呢,分子到处飞,算出来的值和实验值差很多,不知道怎么弄,楼主解决问题了么
9楼2014-06-18 15:12:54
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