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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 关于MS做分子动力学的问题
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Zr891002

金虫 (小有名气)

[求助] 关于MS做分子动力学的问题

为什么我试着用discover或者forcite做分子动力学模拟，不管2W或者3W步还是20W 30W步，感觉那些分子基本在原地动啊，而且还会跑出盒子，谁知道这是为什么啊？怎么解决啊，我看别人做的 分子能从盒子的一边跑到另外一边，而我的模型 基本就左右晃晃！~~

求解啊！~~大神们
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加油，一定能成功
1楼 2013-04-01 18:21:54
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zx2456

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
首先你想做的什么体系啊，还有就是你输入的初始结构是什么样的，如果你输入的结构本来就接近最低能量状态，那么就会出现你这种状况啊。多数还是跟你的初始结构和势函数的选取有关。
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6楼2013-04-02 09:25:13
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Zr891002

金虫 (小有名气)
求救啊！~~~~大神们！~~~~~~
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加油，一定能成功
2楼2013-04-01 19:55:24
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stalart

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-02 08:29:41
你的温度设多少？
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3楼2013-04-01 21:34:41
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Zr891002

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stalart at 2013-04-01 21:34:41
你的温度设多少？

293K
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加油，一定能成功
4楼2013-04-01 21:43:27
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查看全部 9 个回答
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