24小时热门版块排行榜    

查看: 2729  |  回复: 9

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 高分子模拟软件探讨 已有2人参与

各位大侠,本人之前在学校是做有机小分子模拟(几十个原子),用Gaussian和MS,现在毕业工作了,单位是做高分子的

在高分子领域里,原子数和分子量都不算大(几千到一万左右个原子数、几万甚至十来万分子量),做模拟的人都知道,

这已经完全不一样了,而且我们研究的高分子是带支链的无序共聚物(梳型聚合物),一个支链上就有六七百个原子,

如果要研究其构象的话,不能像线型聚合物那样只取一部分,我想把整个分子都建出来,这样在MS里算特别慢,

我想学习新软件,比如Gromacs、Lammps等,由于我之前用的都是商业软件,现在学起新软件来特费劲,

现在求助各位:推荐一款既适合我的体系又好学一点的软件吧?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-06-25 14:02:39
本帖仅楼主可见
2楼2014-06-22 20:40:05
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-06-22 20:40:05
正好跟楼主相反,以前是做高分子模拟的,自己写程序;现在是做小分子模拟,利用lammps。敢问楼主在什么样子的单位工作呢,理论计算在企业能够找到相应的位置???
ps:做生物大分子模拟的话首选gromacs

自己写程序?好高端!有没有你的位置取决于你的老板,最近也在考虑Gromacs呢
3楼2014-06-22 20:44:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

多问问Z. S. li老师吧,守着这么个人,还天天求助emuch,浪费资源。
4楼2014-06-22 21:06:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
5楼2014-06-22 22:53:08
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

gromacs据说比lammps上手快一些,不过用熟了估计都差不多。
6楼2014-06-23 00:19:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tianlangxingaa at 2014-06-22 21:06:48
多问问Z. S. li老师吧,守着这么个人,还天天求助emuch,浪费资源。

你是哪位?
7楼2014-06-23 09:12:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
8楼2014-06-23 16:19:55
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-06-23 16:19:55
我其实是想咨询一下 做计算模拟出身的话有没有往企业发展的出路 换言之是否有一些具体的单位或是企业 希望告知 谢谢!
ps:没有要挤进去的意思,只是做为一个职业规划

如果你是做药物方面的,现在有很多药企需要模拟方面的,其它就是一些科研院所和高校的课题组需要。好多引进人才从国外学习回来,都觉得模拟很重要
9楼2014-06-24 11:06:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beeMD

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-06-25 14:03:43
关注下我们原创开发的BeeMD软件吧,不比Gromacs差的,建模方面更灵活些,一般应用没问题,我们这个也是十多年的开发了,只是发布得晚了些,希望大家使用,多多支持我们开发,有兴趣的可参与开发团队,不相参与写代码,帮助做些MD方面知识点写作也成

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7512802&fpage=1

BeeMD开发团队
10楼2014-06-24 23:46:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Andsharia 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见