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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 高分子模拟软件探讨 已有2人参与

各位大侠，本人之前在学校是做有机小分子模拟（几十个原子），用Gaussian和MS，现在毕业工作了，单位是做高分子的

在高分子领域里，原子数和分子量都不算大（几千到一万左右个原子数、几万甚至十来万分子量），做模拟的人都知道，

这已经完全不一样了，而且我们研究的高分子是带支链的无序共聚物（梳型聚合物），一个支链上就有六七百个原子，

如果要研究其构象的话，不能像线型聚合物那样只取一部分，我想把整个分子都建出来，这样在MS里算特别慢，

我想学习新软件，比如Gromacs、Lammps等，由于我之前用的都是商业软件，现在学起新软件来特费劲，

现在求助各位：推荐一款既适合我的体系又好学一点的软件吧？
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1楼 2014-06-22 16:59:00
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匿名

用户注销 (正式写手)
★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-06-25 14:02:39
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2楼2014-06-22 20:40:05
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-06-22 20:40:05
正好跟楼主相反，以前是做高分子模拟的，自己写程序；现在是做小分子模拟，利用lammps。敢问楼主在什么样子的单位工作呢，理论计算在企业能够找到相应的位置？？？
ps：做生物大分子模拟的话首选gromacs

自己写程序？好高端！有没有你的位置取决于你的老板，最近也在考虑Gromacs呢
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3楼2014-06-22 20:44:44
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tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)
多问问Z. S. li老师吧，守着这么个人，还天天求助emuch，浪费资源。
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4楼2014-06-22 21:06:48
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匿名

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5楼2014-06-22 22:53:08
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
gromacs据说比lammps上手快一些，不过用熟了估计都差不多。
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6楼2014-06-23 00:19:12
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tianlangxingaa at 2014-06-22 21:06:48
多问问Z. S. li老师吧，守着这么个人，还天天求助emuch，浪费资源。

你是哪位？
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7楼2014-06-23 09:12:18
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匿名

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8楼2014-06-23 16:19:55
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-06-23 16:19:55
我其实是想咨询一下 做计算模拟出身的话有没有往企业发展的出路 换言之是否有一些具体的单位或是企业 希望告知 谢谢！
ps：没有要挤进去的意思，只是做为一个职业规划

如果你是做药物方面的，现在有很多药企需要模拟方面的，其它就是一些科研院所和高校的课题组需要。好多引进人才从国外学习回来，都觉得模拟很重要
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9楼2014-06-24 11:06:18
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beeMD

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-06-25 14:03:43
关注下我们原创开发的BeeMD软件吧，不比Gromacs差的，建模方面更灵活些，一般应用没问题，我们这个也是十多年的开发了，只是发布得晚了些，希望大家使用，多多支持我们开发，有兴趣的可参与开发团队，不相参与写代码，帮助做些MD方面知识点写作也成

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7512802&fpage=1

BeeMD开发团队
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10楼2014-06-24 23:46:37
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