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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【求助】模拟高分子自组装
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sunjp82

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】模拟高分子自组装已有5人参与

在网上搜了很久，很少看到有讨论模拟高分子自组装聚集结构的文章，请教各位高手都有些什么软件可以进行此类模拟，在MS中是用哪个模块模拟更准确适用，谢谢各位了！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:22 ]
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1楼2009-07-31 08:48:38
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

xiao_alpha

木虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 欢迎常来 12-31 09:22
内容已删除
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9楼2009-12-31 05:27:27
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-02 08:18
我传了个嵌段共聚物的MC程序，供大家参考。。
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好好学习，天天向上。
15楼2010-04-01 23:48:53
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普通回帖

recoli

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
sunjp82(金币+1,VIP+0):我看到过很多的用自洽场理论并用计算机模拟高分子自组装的文章，但不知道用什么软件 8-1 17:24
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 8-2 13:28
现有的力场不一定能准确模拟形成超分子的作用力（范德华力，疏水亲水，pi-pi共轭，等等）。甚至DFT也不能完全再现这些远程作用。这是一个比较大的难点，也是少有模拟计算文章的原因。对于一些超分子自组装的机理，想起来是很简单的，解释也很通俗，但是要想真的用模拟计算来再现，还是很有难度的。
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2楼2009-07-31 12:25:30
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zczc6

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-2 13:28
sunjp82(金币+1,VIP+0):谢谢关注，我现在也正在摸索，有眉目了再与大家讨论 8-4 00:28
计算能力也是一个大问题，单个分子就大的难以计算，加上环境、力场不确定等因素，应该只能提交到超级计算服务器才能完成。
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3楼2009-08-01 21:37:52
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
sunjp82(金币+1,VIP+0):谢谢，不知道用什么软件比较方便准确 8-29 16:31
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 12:36
不是非要用力场才能模拟自组装，例如嵌段高分子的微相分离，MC和自洽场都能做。还是要具体问题具体分析，不过粗粒化是必需的选择
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4楼2009-08-27 14:04:19
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abbottfdu

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 12:36
关于自组装的理论与模拟很多.
参看中国科学技术大学梁好君教授课题组和天津大学何学浩教授课题组的工作.
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5楼2009-10-14 00:46:51
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 12:37
引用回帖:
Originally posted by abbottfdu at 2009-10-14 00:46:
关于自组装的理论与模拟很多.
参看中国科学技术大学梁好君教授课题组和天津大学何学浩教授课题组的工作.

梁老师的名字应该是这个“均”。。他们两是很牛的，你可以搜下最近的文章，不过人家的程序是自己编的，，，不清楚现在有什么开源程序或者商业程序能算SCFT的
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
6楼2009-12-14 22:49:24
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 12:37
做自洽场的话，程序还是比较简单的，一般自己写，或者去网上求源码。。。
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2009-7-31 12:25:
现有的力场不一定能准确模拟形成超分子的作用力（范德华力，疏水亲水，pi-pi共轭，等等）。甚至DFT也不能完全再现这些远程作用。这是一个比较大的难点，也是少有模拟计算文章的原因。对于一些超分子自组装的机理， ...

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分子模拟的主页http://varmilion.tk/
7楼2009-12-16 09:03:45
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coy123

金虫 (正式写手)

请问哪里可以找到自洽场的源码?多谢!

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问哪里可以找到自洽场的源码?多谢!
引用回帖:
Originally posted by zhuhongaaa at 2009-12-16 09:03:
做自洽场的话，程序还是比较简单的，一般自己写，或者去网上求源码。。。
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8楼2009-12-18 05:03:01
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dellus

木虫 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 1-3 09:20
SCFT速度比MC，DPD（或MD）快很多，但有一个缺憾，不能计算体系的涨落
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岂能尽如人意，但求无愧于心。
10楼2010-01-03 08:51:57
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