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sunjp82

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】模拟高分子自组装已有5人参与

在网上搜了很久,很少看到有讨论模拟高分子自组装聚集结构的文章,请教各位高手都有些什么软件可以进行此类模拟,在MS中是用哪个模块模拟更准确适用,谢谢各位了!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:22 ]
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 12:37
做自洽场的话,程序还是比较简单的,一般自己写,或者去网上求源码。。。
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2009-7-31 12:25:
现有的力场不一定能准确模拟形成超分子的作用力(范德华力,疏水亲水,pi-pi共轭,等等)。甚至DFT也不能完全再现这些远程作用。这是一个比较大的难点,也是少有模拟计算文章的原因。对于一些超分子自组装的机理, ...

分子模拟的主页http://varmilion.tk/
7楼2009-12-16 09:03:45
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查看全部 25 个回答

recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
sunjp82(金币+1,VIP+0):我看到过很多的用自洽场理论并用计算机模拟高分子自组装的文章,但不知道用什么软件 8-1 17:24
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 8-2 13:28
现有的力场不一定能准确模拟形成超分子的作用力(范德华力,疏水亲水,pi-pi共轭,等等)。甚至DFT也不能完全再现这些远程作用。这是一个比较大的难点,也是少有模拟计算文章的原因。对于一些超分子自组装的机理,想起来是很简单的,解释也很通俗,但是要想真的用模拟计算来再现,还是很有难度的。
2楼2009-07-31 12:25:30
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zczc6

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-2 13:28
sunjp82(金币+1,VIP+0):谢谢关注,我现在也正在摸索,有眉目了再与大家讨论 8-4 00:28
计算能力也是一个大问题,单个分子就大的难以计算,加上环境、力场不确定等因素,应该只能提交到超级计算服务器才能完成。
3楼2009-08-01 21:37:52
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
sunjp82(金币+1,VIP+0):谢谢,不知道用什么软件比较方便准确 8-29 16:31
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 12:36
不是非要用力场才能模拟自组装,例如嵌段高分子的微相分离,MC和自洽场都能做。还是要具体问题具体分析,不过粗粒化是必需的选择
4楼2009-08-27 14:04:19
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