24小时热门版块排行榜    

查看: 2742  |  回复: 9

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 高分子模拟软件探讨 已有2人参与

各位大侠,本人之前在学校是做有机小分子模拟(几十个原子),用Gaussian和MS,现在毕业工作了,单位是做高分子的

在高分子领域里,原子数和分子量都不算大(几千到一万左右个原子数、几万甚至十来万分子量),做模拟的人都知道,

这已经完全不一样了,而且我们研究的高分子是带支链的无序共聚物(梳型聚合物),一个支链上就有六七百个原子,

如果要研究其构象的话,不能像线型聚合物那样只取一部分,我想把整个分子都建出来,这样在MS里算特别慢,

我想学习新软件,比如Gromacs、Lammps等,由于我之前用的都是商业软件,现在学起新软件来特费劲,

现在求助各位:推荐一款既适合我的体系又好学一点的软件吧?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-06-25 14:02:39
本帖仅楼主可见
2楼2014-06-22 20:40:05
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-06-22 20:40:05
正好跟楼主相反,以前是做高分子模拟的,自己写程序;现在是做小分子模拟,利用lammps。敢问楼主在什么样子的单位工作呢,理论计算在企业能够找到相应的位置???
ps:做生物大分子模拟的话首选gromacs

自己写程序?好高端!有没有你的位置取决于你的老板,最近也在考虑Gromacs呢
3楼2014-06-22 20:44:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

多问问Z. S. li老师吧,守着这么个人,还天天求助emuch,浪费资源。
4楼2014-06-22 21:06:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
5楼2014-06-22 22:53:08
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

gromacs据说比lammps上手快一些,不过用熟了估计都差不多。
6楼2014-06-23 00:19:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tianlangxingaa at 2014-06-22 21:06:48
多问问Z. S. li老师吧,守着这么个人,还天天求助emuch,浪费资源。

你是哪位?
7楼2014-06-23 09:12:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
8楼2014-06-23 16:19:55
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-06-23 16:19:55
我其实是想咨询一下 做计算模拟出身的话有没有往企业发展的出路 换言之是否有一些具体的单位或是企业 希望告知 谢谢!
ps:没有要挤进去的意思,只是做为一个职业规划

如果你是做药物方面的,现在有很多药企需要模拟方面的,其它就是一些科研院所和高校的课题组需要。好多引进人才从国外学习回来,都觉得模拟很重要
9楼2014-06-24 11:06:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beeMD

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-06-25 14:03:43
关注下我们原创开发的BeeMD软件吧,不比Gromacs差的,建模方面更灵活些,一般应用没问题,我们这个也是十多年的开发了,只是发布得晚了些,希望大家使用,多多支持我们开发,有兴趣的可参与开发团队,不相参与写代码,帮助做些MD方面知识点写作也成

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7512802&fpage=1

BeeMD开发团队
10楼2014-06-24 23:46:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Andsharia 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 15:18 by KM5EcsNQRBPn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 5/250 2026-08-23 14:33 by KM5EcsNQRBPn
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 什么时候开奖? +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15 羊腰板 2026-08-21 16/800 2026-08-23 10:45 by process2012
[基金申请] 让我中一个面上吧! +12 大萍1987 2026-08-20 14/700 2026-08-23 10:30 by wrm
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 5/250 2026-08-23 04:07 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
信息提示
请填处理意见